MSR1

MSR1
Ідентифікатори
Символи	MSR1, CD204, SCARA1, SR-A, SRA, phSR1, phSR2, macrophage scavenger receptor 1, SR-AI, SR-AII, SR-AIII
Зовнішні ІД	OMIM: 153622 MGI: 98257 HomoloGene: 12822 GeneCards: MSR1
Онтологія гена Молекулярна функція • scavenger receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • low-density lipoprotein particle binding • amyloid-beta binding • cargo receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • endocytic vesicle membrane • гіалоплазма • клітинна мембрана • колаген • integral component of plasma membrane • мембрана • low-density lipoprotein particle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle Біологічний процес • cholesterol transport • plasma lipoprotein particle clearance • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation • ендоцитоз • рецептор-опосередкований ендоцитоз • lipoprotein transport • positive regulation of cholesterol storage • phagocytosis, engulfment • negative regulation of gene expression • amyloid-beta clearance Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4481	20288
Ensembl	ENSG00000038945	ENSMUSG00000025044
UniProt	P21757	P30204
RefSeq (мРНК)	NM_138716 NM_002445 NM_138715 NM_001363744	NM_001113326 NM_031195
RefSeq (білок)	NP_002436 NP_619729 NP_619730 NP_001350673	NP_001106797 NP_112472
Локус (UCSC)	Хр. 8: 16.11 – 16.57 Mb	Хр. 8: 40.03 – 40.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MSR1 (англ. Macrophage scavenger receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот, а молекулярна маса — 49 762.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEQWDHFHNQ		QEDTDSCSES		VKFDARSMTA		LLPPNPKNSP		SLQEKLKSFK
AALIALYLLV		FAVLIPLIGI		VAAQLLKWET		KNCSVSSTNA		NDITQSLTGK
GNDSEEEMRF		QEVFMEHMSN		MEKRIQHILD		MEANLMDTEH		FQNFSMTTDQ
RFNDILLQLS		TLFSSVQGHG		NAIDEISKSL		ISLNTTLLDL		QLNIENLNGK
IQENTFKQQE		EISKLEERVY		NVSAEIMAMK		EEQVHLEQEI		KGEVKVLNNI
TNDLRLKDWE		HSQTLRNITL		IQGPPGPPGE		KGDRGPTGES		GPRGFPGPIG
PPGLKGDRGA		IGFPGSRGLP		GYAGRPGNSG		PKGQKGEKGS		GNTLTPFTKV
RLVGGSGPHE		GRVEILHSGQ		WGTICDDRWE		VRVGQVVCRS		LGYPGVQAVH
KAAHFGQGTG		PIWLNEVFCF		GRESSIEECK		IRQWGTRACS		HSEDAGVTCT
L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Resnick D., Chatterton J.E., Schwartz K., Slayter H., Krieger M. (1996). Structures of class A macrophage scavenger receptors. Electron microscopic study of flexible, multidomain, fibrous proteins and determination of the disulfide bond pattern of the scavenger receptor cysteine-rich domain. J. Biol. Chem. 271: 26924—26930. PMID 8900177 DOI:10.1074/jbc.271.43.26924
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8
• Gough P.J., Greaves D.R., Gordon S. (1998). A naturally occurring isoform of the human macrophage scavenger receptor (SR-A) gene generated by alternative splicing blocks modified LDL uptake. J. Lipid Res. 39: 531—543. PMID 9548586

Див. також

• Хромосома 8