Ламін B1

Ламін B1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KPW, 3JT0, 3TYY, 3UMN
Ідентифікатори
Символи	LMNB1, ADLD, LMN, LMN2, LMNB, lamin B1, MCPH26
Зовнішні ІД	OMIM: 150340 MGI: 96795 HomoloGene: 55912 GeneCards: LMNB1
Пов'язані генетичні захворювання
adult-onset autosomal dominant demyelinating leukodystrophy
Онтологія гена Молекулярна функція • phospholipase binding • structural molecule activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • double-stranded DNA binding • sequence-specific double-stranded DNA binding Клітинна компонента • nuclear matrix • nuclear inner membrane • ядерна мембрана • мембрана • Проміжні філаменти • lamin filament • нуклеоплазма • клітинне ядро • nuclear envelope Біологічний процес • interleukin-12-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4001	16906
Ensembl	ENSG00000113368	ENSMUSG00000024590
UniProt	P20700	P14733
RefSeq (мРНК)	NM_001198557 NM_005573	NM_010721
RefSeq (білок)	NP_001185486 NP_005564	NP_034851
Локус (UCSC)	Хр. 5: 126.78 – 126.84 Mb	Хр. 18: 56.84 – 56.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Ламін B1 (англ. Lamin B1) – білок, який кодується геном LMNB1, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 586 амінокислот, а молекулярна маса — 66 408.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATATPVPPR		MGSRAGGPTT		PLSPTRLSRL		QEKEELRELN		DRLAVYIDKV
RSLETENSAL		QLQVTEREEV		RGRELTGLKA		LYETELADAR		RALDDTARER
AKLQIELGKC		KAEHDQLLLN		YAKKESDLNG		AQIKLREYEA		ALNSKDAALA
TALGDKKSLE		GDLEDLKDQI		AQLEASLAAA		KKQLADETLL		KVDLENRCQS
LTEDLEFRKS		MYEEEINETR		RKHETRLVEV		DSGRQIEYEY		KLAQALHEMR
EQHDAQVRLY		KEELEQTYHA		KLENARLSSE		MNTSTVNSAR		EELMESRMRI
ESLSSQLSNL		QKESRACLER		IQELEDLLAK		EKDNSRRMLT		DKEREMAEIR
DQMQQQLNDY		EQLLDVKLAL		DMEISAYRKL		LEGEEERLKL		SPSPSSRVTV
SRASSSRSVR		TTRGKRKRVD		VEESEASSSV		SISHSASATG		NVCIEEIDVD
GKFIRLKNTS		EQDQPMGGWE		MIRKIGDTSV		SYKYTSRYVL		KAGQTVTIWA
ANAGVTASPP		TDLIWKNQNS		WGTGEDVKVI		LKNSQGEEVA		QRSTVFKTTI
PEEEEEEEEA		AGVVVEEELF		HQQGTPRASN		RSCAIM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у ядрі, мембрані.

Література

• Lin F., Worman H.J. (1995). Structural organization of the human gene (LMNB1) encoding nuclear lamin B1. Genomics. 27: 230—236. PMID 7557986 DOI:10.1006/geno.1995.1036
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Farnsworth C.C., Wolda S.L., Gelb M.H., Glomset J.A. (1989). Human lamin B contains a farnesylated cysteine residue. J. Biol. Chem. 264: 20422—20429. PMID 2684976

Див. також

• Хромосома 5