MYO6

MYO6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2N11, 2N13, 2N0Z, 2N10, 2N12
Ідентифікатори
Символи	MYO6, DFNA22, DFNB37, myosin VI, Myo6-008, Myo6-007
Зовнішні ІД	OMIM: 600970 MGI: 104785 HomoloGene: 56417 GeneCards: MYO6
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal recessive nonsyndromic deafness 37, nonsyndromic deafness, autosomal dominant nonsyndromic deafness 22
Онтологія гена Молекулярна функція • cytoskeletal motor activity • actin filament binding • ATP binding • calmodulin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • minus-end directed microfilament motor activity • ADP binding • actin binding • nucleotide binding • cadherin binding • identical protein binding Клітинна компонента • myosin complex • клітинне ядро • внутрішньоклітинна мембранна органела • cell projection • ruffle membrane • RNA polymerase II, holoenzyme • нуклеоплазма • lysosomal membrane • perinuclear region of cytoplasm • clathrin-coated endocytic vesicle • apical part of cell • clathrin-coated vesicle membrane • ruffle • гіалоплазма • екзосома • мембрана • clathrin-coated pit • filamentous actin • клітинна мембрана • ядерна мембрана • цитоплазма • cell cortex • Мікроворсинки • комплекс Ґольджі • unconventional myosin complex • endocytic vesicle • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • мікрофіламент • GO:0009327 protein-containing complex • clathrin-coated vesicle • Філоподія Біологічний процес • intracellular protein transport • actin filament-based movement • regulation of secretion • слух • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • protein transport • ендоцитоз • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • GO:0015915 транспорт Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4646	17920
Ensembl	ENSG00000196586	ENSMUSG00000033577
UniProt	Q9UM54	Q64331
RefSeq (мРНК)	NM_001300899 NM_004999 NM_001368136 NM_001368137 NM_001368138 NM_001368139 NM_001368140 NM_001368865 NM_001368866	NM_001039546 NM_008662
RefSeq (білок)	NP_001287828 NP_004990 NP_001355065 NP_001355066 NP_001355067 NP_001355068 NP_001355069 NP_001355794 NP_001355795	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 75.75 – 75.92 Mb	Хр. 9: 80.07 – 80.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MYO6 (англ. Myosin VI) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 294 амінокислот, а молекулярна маса — 149 691.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDGKPVWAP		HPTDGFQMGN		IVDIGPDSLT		IEPLNQKGKT		FLALINQVFP
AEEDSKKDVE		DNCSLMYLNE		ATLLHNIKVR		YSKDRIYTYV		ANILIAVNPY
FDIPKIYSSE		AIKSYQGKSL		GTRPPHVFAI		ADKAFRDMKV		LKMSQSIIVS
GESGAGKTEN		TKFVLRYLTE		SYGTGQDIDD		RIVEANPLLE		AFGNAKTVRN
NNSSRFGKFV		EIHFNEKSSV		VGGFVSHYLL		EKSRICVQGK		EERNYHIFYR
LCAGASEDIR		EKLHLSSPDN		FRYLNRGCTR		YFANKETDKQ		ILQNRKSPEY
LKAGSMKDPL		LDDHGDFIRM		CTAMKKIGLD		DEEKLDLFRV		VAGVLHLGNI
DFEEAGSTSG		GCNLKNKSAQ		SLEYCAELLG		LDQDDLRVSL		TTRVMLTTAG
GTKGTVIKVP		LKVEQANNAR		DALAKTVYSH		LFDHVVNRVN		QCFPFETSSY
FIGVLDIAGF		EYFEHNSFEQ		FCINYCNEKL		QQFFNERILK		EEQELYQKEG
LGVNEVHYVD		NQDCIDLIEA		KLVGILDILD		EENRLPQPSD		QHFTSAVHQK
HKDHFRLTIP		RKSKLAVHRN		IRDDEGFIIR		HFAGAVCYET		TQFVEKNNDA
LHMSLESLIC		ESRDKFIREL		FESSTNNNKD		TKQKAGKLSF		ISVGNKFKTQ
LNLLLDKLRS		TGASFIRCIK		PNLKMTSHHF		EGAQILSQLQ		CSGMVSVLDL
MQGGYPSRAS		FHELYNMYKK		YMPDKLARLD		PRLFCKALFK		ALGLNENDYK
FGLTKVFFRP		GKFAEFDQIM		KSDPDHLAEL		VKRVNHWLTC		SRWKKVQWCS
LSVIKLKNKI		KYRAEACIKM		QKTIRMWLCK		RRHKPRIDGL		VKVGTLKKRL
DKFNEVVSVL		KDGKPEMNKQ		IKNLEISIDT		LMAKIKSTMM		TQEQIQKEYD
ALVKSSEELL		SALQKKKQQE		EEAERLRRIQ		EEMEKERKRR		EEDEKRRRKE
EEERRMKLEM		EAKRKQEEEE		RKKREDDEKR		IQAEVEAQLA		RQKEEESQQQ
AVLEQERRDR		ELALRIAQSE		AELISDEAQA		DLALRRSLDS		YPVSKNDGTR
PKMTPEQMAK		EMSEFLSRGP		AVLATKAAAG		TKKYDLSKWK		YAELRDTINT
SCDIELLAAC		REEFHRRLKV		YHAWKSKNKK		RNTETEQRAP		KSVTDYDFAP
FLNNSPQQNP		AAQIPARQRE		IEMNRQQRFF		RIPFIRPADQ		YKDPQSKKKG
WWYAHFDGPW		IARQMELHPD		KPPILLVAGK		DDMEMCELNL		EETGLTRKRG
AEILPRQFEE		IWERCGGIQY		LQNAIESRQA		RPTYATAMLQ		SLLK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, міозинів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою актину, молекулою кальмодуліну. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Buss F., Arden S.D., Lindsay M., Luzio J.P., Kendrick-Jones J. (2001). Myosin VI isoform localized to clathrin-coated vesicles with a role in clathrin-mediated endocytosis. EMBO J. 20: 3676—3684. PMID 11447109 DOI:10.1093/emboj/20.14.3676
• Jung E.J., Liu G., Zhou W., Chen X. (2006). Myosin VI is a mediator of the p53-dependent cell survival pathway. Mol. Cell. Biol. 26: 2175—2186. PMID 16507995 DOI:10.1128/MCB.26.6.2175-2186.2006
• Spink B.J., Sivaramakrishnan S., Lipfert J., Doniach S., Spudich J.A. (2008). Long single alpha-helical tail domains bridge the gap between structure and function of myosin VI. Nat. Struct. Mol. Biol. 15: 591—597. PMID 18511944 DOI:10.1038/nsmb.1429

Див. також

• Хромосома 6