KCNJ4

KCNJ4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3GJ9
Ідентифікатори
Символи	KCNJ4, HIR, HIRK2, HRK1, IRK-3, IRK3, Kir2.3, potassium voltage-gated channel subfamily J member 4, potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 4
Зовнішні ІД	OMIM: 600504 MGI: 104743 HomoloGene: 3653 GeneCards: KCNJ4
Реагує на сполуку
	Арахідонова кислота, Путресцин, SCH-23390, spermidine, spermine, tetraethylammonium, гідрон
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • voltage-gated ion channel activity; • PDZ domain binding; • inward rectifier potassium channel activity; • G-protein activated inward rectifier potassium channel activity;
Клітинна компонента	• синапс; • cytoplasmic vesicle membrane; • voltage-gated potassium channel complex; • міжклітинні контакти; • integral component of membrane; • мембрана; • GO:0016023 cytoplasmic vesicle; • basolateral plasma membrane; • postsynaptic membrane; • клітинна мембрана;
Біологічний процес	• regulation of ion transmembrane transport; • ion transport; • potassium ion transport; • potassium ion import across plasma membrane; • cardiac conduction;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3761
	16520
	ENSG00000168135
	ENSMUSG00000044216
	P48050
	P52189
	NM_152868; NM_004981
	NM_008427
	NP_004972; NP_690607
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KCNJ4 (англ. Potassium voltage-gated channel subfamily J member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 445 амінокислот, а молекулярна маса — 49 500^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MHGHSRNGQA	HVPRRKRRNR	FVKKNGQCNV	YFANLSNKSQ	RYMADIFTTC
VDTRWRYMLM	IFSAAFLVSW	LFFGLLFWCI	AFFHGDLEAS	PGVPAAGGPA
AGGGGAAPVA	PKPCIMHVNG	FLGAFLFSVE	TQTTIGYGFR	CVTEECPLAV
IAVVVQSIVG	CVIDSFMIGT	IMAKMARPKK	RAQTLLFSHH	AVISVRDGKL
CLMWRVGNLR	KSHIVEAHVR	AQLIKPYMTQ	EGEYLPLDQR	DLNVGYDIGL
DRIFLVSPII	IVHEIDEDSP	LYGMGKEELE	SEDFEIVVIL	EGMVEATAMT
TQARSSYLAS	EILWGHRFEP	VVFEEKSHYK	VDYSRFHKTY	EVAGTPCCSA
RELQESKITV	LPAPPPPPSA	FCYENELALM	SQEEEEMEEE	AAAAAAVAAG
LGLEAGSKEE	AGIIRMLEFG	SHLDLERMQA	SLPLDNISYR	RESAI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію. Білок має сайт для зв'язування з калію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, цитоплазматичних везикулах, синапсах.

Література

Perier F., Radeke C.M., Vandenberg C.A. (1994). Primary structure and characterization of a small-conductance inwardly rectifying potassium channel from human hippocampus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 6240—6244. PMID 8016146 DOI:10.1073/pnas.91.13.6240
Tang W., Yang X.-C. (1994). Cloning a novel human brain inward rectifier potassium channel and its functional expression in Xenopus oocytes. FEBS Lett. 348: 239—243. PMID 8034048 DOI:10.1016/0014-5793(94)00612-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Coulter K.L., Perier F., Radeke C.M., Vandenberg C.A. (1995). Identification and molecular localization of a pH-sensing domain for the inward rectifier potassium channel HIR. Neuron. 15: 1157—1168. PMID 7576658 DOI:10.1016/0896-6273(95)90103-5
Makhina E.N., Kelly A.J., Lopatin A.N., Mercer R.W., Nichols C.G. (1994). Cloning and expression of a novel human brain inward rectifier potassium channel. J. Biol. Chem. 269: 20468—20474. PMID 8051145

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6265 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P48050 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 22

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6265 (англ.) . Процитовано 22 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P48050 (англ.) . Архів оригіналу за 22 липня 2017. Процитовано 22 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

KCNJ4

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук