CACNA1E

CACNA1E
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BXL
Ідентифікатори
Символи	CACNA1E, BII, CACH6, CACNL1A6, Cav2.3, calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E, gm139, EIEE69, DEE69
Зовнішні ІД	OMIM: 601013 MGI: 106217 HomoloGene: 20185 GeneCards: CACNA1E
Реагує на сполуку
bepridil hydrochloride monohydrate
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • voltage-gated calcium channel activity • зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity • high voltage-gated calcium channel activity • ion channel activity • calcium channel activity Клітинна компонента • voltage-gated calcium channel complex • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана Біологічний процес • membrane depolarization during action potential • regulation of insulin secretion • regulation of ion transmembrane transport • membrane depolarization • ion transport • calcium ion transmembrane transport • трансмембранний транспорт • calcium ion transport • chemical synaptic transmission • calcium ion import Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	777	12290
Ensembl	ENSG00000198216	ENSMUSG00000004110
UniProt	Q15878	Q61290
RefSeq (мРНК)	NM_000721 NM_001205293 NM_001205294	NM_009782
RefSeq (білок)	NP_000712 NP_001192222 NP_001192223	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 181.32 – 181.81 Mb	Хр. 1: 154.27 – 154.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CACNA1E (англ. Calcium voltage-gated channel subunit alpha1 E) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 313 амінокислот, а молекулярна маса — 261 731.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARFGEAVVA		RPGSGDGDSD		QSRNRQGTPV		PASGQAAAYK		QTKAQRARTM
ALYNPIPVRQ		NCFTVNRSLF		IFGEDNIVRK		YAKKLIDWPP		FEYMILATII
ANCIVLALEQ		HLPEDDKTPM		SRRLEKTEPY		FIGIFCFEAG		IKIVALGFIF
HKGSYLRNGW		NVMDFIVVLS		GILATAGTHF		NTHVDLRTLR		AVRVLRPLKL
VSGIPSLQIV		LKSIMKAMVP		LLQIGLLLFF		AILMFAIIGL		EFYSGKLHRA
CFMNNSGILE		GFDPPHPCGV		QGCPAGYECK		DWIGPNDGIT		QFDNILFAVL
TVFQCITMEG		WTTVLYNTND		ALGATWNWLY		FIPLIIIGSF		FVLNLVLGVL
SGEFAKERER		VENRRAFMKL		RRQQQIEREL		NGYRAWIDKA		EEVMLAEENK
NAGTSALEVL		RRATIKRSRT		EAMTRDSSDE		HCVDISSVGT		PLARASIKSA
KVDGVSYFRH		KERLLRISIR		HMVKSQVFYW		IVLSLVALNT		ACVAIVHHNQ
PQWLTHLLYY		AEFLFLGLFL		LEMSLKMYGM		GPRLYFHSSF		NCFDFGVTVG
SIFEVVWAIF		RPGTSFGISV		LRALRLLRIF		KITKYWASLR		NLVVSLMSSM
KSIISLLFLL		FLFIVVFALL		GMQLFGGRFN		FNDGTPSANF		DTFPAAIMTV
FQILTGEDWN		EVMYNGIRSQ		GGVSSGMWSA		IYFIVLTLFG		NYTLLNVFLA
IAVDNLANAQ		ELTKDEQEEE		EAFNQKHALQ		KAKEVSPMSA		PNMPSIERDR
RRRHHMSMWE		PRSSHLRERR		RRHHMSVWEQ		RTSQLRKHMQ		MSSQEALNRE
EAPTMNPLNP		LNPLSSLNPL		NAHPSLYRRP		RAIEGLALGL		ALEKFEEERI
SRGGSLKGDG		GDRSSALDNQ		RTPLSLGQRE		PPWLARPCHG		NCDPTQQEAG
GGEAVVTFED		RARHRQSQRR		SRHRRVRTEG		KESSSASRSR		SASQERSLDE
AMPTEGEKDH		ELRGNHGAKE		PTIQEERAQD		LRRTNSLMVS		RGSGLAGGLD
EADTPLVLPH		PELEVGKHVV		LTEQEPEGSS		EQALLGNVQL		DMGRVISQSE
PDLSCITANT		DKATTESTSV		TVAIPDVDPL		VDSTVVHISN		KTDGEASPLK
EAEIREDEEE		VEKKKQKKEK		RETGKAMVPH		SSMFIFSTTN		PIRRACHYIV
NLRYFEMCIL		LVIAASSIAL		AAEDPVLTNS		ERNKVLRYFD		YVFTGVFTFE
MVIKMIDQGL		ILQDGSYFRD		LWNILDFVVV		VGALVAFALA		NALGTNKGRD
IKTIKSLRVL		RVLRPLKTIK		RLPKLKAVFD		CVVTSLKNVF		NILIVYKLFM
FIFAVIAVQL		FKGKFFYCTD		SSKDTEKECI		GNYVDHEKNK		MEVKGREWKR
HEFHYDNIIW		ALLTLFTVST		GEGWPQVLQH		SVDVTEEDRG		PSRSNRMEMS
IFYVVYFVVF		PFFFVNIFVA		LIIITFQEQG		DKMMEECSLE		KNERACIDFA
ISAKPLTRYM		PQNRHTFQYR		VWHFVVSPSF		EYTIMAMIAL		NTVVLMMKYY
SAPCTYELAL		KYLNIAFTMV		FSLECVLKVI		AFGFLNYFRD		TWNIFDFITV
IGSITEIILT		DSKLVNTSGF		NMSFLKLFRA		ARLIKLLRQG		YTIRILLWTF
VQSFKALPYV		CLLIAMLFFI		YAIIGMQVFG		NIKLDEESHI		NRHNNFRSFF
GSLMLLFRSA		TGEAWQEIML		SCLGEKGCEP		DTTAPSGQNE		NERCGTDLAY
VYFVSFIFFC		SFLMLNLFVA		VIMDNFEYLT		RDSSILGPHH		LDEFVRVWAE
YDRAACGRIH		YTEMYEMLTL		MSPPLGLGKR		CPSKVAYKRL		VLMNMPVAED
MTVHFTSTLM		ALIRTALDIK		IAKGGADRQQ		LDSELQKETL		AIWPHLSQKM
LDLLVPMPKA		SDLTVGKIYA		AMMIMDYYKQ		SKVKKQRQQL		EEQKNAPMFQ
RMEPSSLPQE		IIANAKALPY		LQQDPVSGLS		GRSGYPSMSP		LSPQDIFQLA
CMDPADDGQF		QERQSLEPEV		SELKSVQPSN		HGIYLPSDTQ		EHAGSGRASS
MPRLTVDPQV		VTDPSSMRRS		FSTIRDKRSN		SSWLEEFSME		RSSENTYKSR
RRSYHSSLRL		SAHRLNSDSG		HKSDTHRSGG		RERGRSKERK		HLLSPDVSRC
NSEERGTQAD		WESPERRQSR		SPSEGRSQTP		NRQGTGSLSE		SSIPSVSDTS
TPRRSRRQLP		PVPPKPRPLL		SYSSLIRHAG		SISPPADGSE		EGSPLTSQAL
ESNNACLTES		SNSPHPQQSQ		HASPQRYISE		PYLALHEDSH		ASDCGEEETL
TFEAAVATSL		GRSNTIGSAP		PLRHSWQMPN		GHYRRRRRGG		PGPGMMCGAV
NNLLSDTEED		DKC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, транспорт кальцію. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

• Mori M.X., Vander Kooi C.W., Leahy D.J., Yue D.T. (2008). Crystal structure of the CaV2 IQ domain in complex with Ca2+/calmodulin: high-resolution mechanistic implications for channel regulation by Ca2+. Structure. 16: 607—620. PMID 18400181 DOI:10.1016/j.str.2008.01.011

Див. також

• Хромосома 1