KCNIP1

KCNIP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1S1E, 2I2R, 2NZ0
Ідентифікатори
Символи	KCNIP1, KCHIP1, VABP, potassium voltage-gated channel interacting protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604660 MGI: 1917607 HomoloGene: 22824 GeneCards: KCNIP1
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • potassium channel regulator activity • potassium channel activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • voltage-gated ion channel activity Клітинна компонента • цитоплазма • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • voltage-gated potassium channel complex • клітинна мембрана • cell projection • дендрит (нейробіологія) • мембрана Біологічний процес • potassium ion transport • regulation of ion transmembrane transport • ion transport • regulation of potassium ion transmembrane transport • potassium ion transmembrane transport • cardiac conduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	30820	70357
Ensembl	ENSG00000182132	ENSMUSG00000053519
UniProt	Q9NZI2	Q9JJ57
RefSeq (мРНК)	NM_001034837 NM_001034838 NM_001278339 NM_001278340 NM_014592	NM_001190885 NM_001190886 NM_001290690 NM_027398 NM_001363115
RefSeq (білок)	NP_001030009 NP_001030010 NP_001265268 NP_001265269 NP_055407	NP_001177814 NP_001177815 NP_001277619 NP_081674 NP_001350044
Локус (UCSC)	Хр. 5: 170.35 – 170.74 Mb	Хр. 11: 33.58 – 33.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KCNIP1 (англ. Potassium voltage-gated channel interacting protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 227 амінокислот, а молекулярна маса — 26 817.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGAVMGTFSS		LQTKQRRPSK		DIAWWYYQYQ		RDKIEDELEM		TMVCHRPEGL
EQLEAQTNFT		KRELQVLYRG		FKNECPSGVV		NEDTFKQIYA		QFFPHGDAST
YAHYLFNAFD		TTQTGSVKFE		DFVTALSILL		RGTVHEKLRW		TFNLYDINKD
GYINKEEMMD		IVKAIYDMMG		KYTYPVLKED		TPRQHVDVFF		QKMDKNKDGI
VTLDEFLESC		QEDDNIMRSL		QLFQNVM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, потенціалзалежних каналів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт іонів, транспорт, транспорт калію, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, калію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Pruunsild P., Timmusk T. (2005). Structure, alternative splicing, and expression of the human and mouse KCNIP gene family. Genomics. 86: 581—593. PMID 16112838 DOI:10.1016/j.ygeno.2005.07.001
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Van Hoorick D., Raes A., Keysers W., Mayeur E., Snyders D.J. (2003). Differential modulation of Kv4 kinetics by KCHIP1 splice variants. Mol. Cell. Neurosci. 24: 357—366. PMID 14572458 DOI:10.1016/S1044-7431(03)00174-X
• Lin Y.-L., Lin S.-R., Wu T.T., Chang L.-S. (2004). Evidence showing an intermolecular interaction between KChIP proteins and Taiwan cobra cardiotoxins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 319: 720—724. PMID 15184042 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.05.064
• Lin Y.-L., Chen C.Y., Cheng C.P., Chang L.S. (2004). Protein-protein interactions of KChIP proteins and Kv4.2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 321: 606—610. PMID 15358149 DOI:10.1016/j.bbrc.2004.07.006
• Pioletti M., Findeisen F., Hura G.L., Minor D.L. Jr. (2006). Three-dimensional structure of the KChIP1-Kv4.3 T1 complex reveals a cross-shaped octamer. Nat. Struct. Mol. Biol. 13: 987—995. PMID 17057713 DOI:10.1038/nsmb1164

Див. також

• Хромосома 5