COL19A1

COL19A1
Ідентифікатори
Символи	COL19A1, COL9A1L, D6S228E, collagen type XIX alpha 1, collagen type XIX alpha 1 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 120165 MGI: 1095415 HomoloGene: 55608 GeneCards: COL19A1
Онтологія гена Молекулярна функція • protein-macromolecule adaptor activity • extracellular matrix structural constituent • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength Клітинна компонента • endoplasmic reticulum lumen • колаген • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • collagen catabolic process • multicellular organism development • skeletal system development • диференціація клітин • muscle organ development • skeletal muscle tissue development • extracellular matrix organization • адгезія клітин • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1310	12823
Ensembl	ENSG00000082293	ENSMUSG00000026141
UniProt	Q14993	Q0VF58
RefSeq (мРНК)	NM_001858	NM_007733
RefSeq (білок)	NP_001849	NP_031759
Локус (UCSC)	Хр. 6: 69.87 – 70.21 Mb	Хр. 1: 24.3 – 24.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COL19A1 (англ. Collagen type XIX alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 142 амінокислот, а молекулярна маса — 115 221.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLTGPWKLW		LWMSIFLLPA		STSVTVRDKT		EESCPILRIE		GHQLTYDNIN
KLEVSGFDLG		DSFSLRRAFC		ESDKTCFKLG		SALLIRDTIK		IFPKGLPEEY
SVAAMFRVRR		NAKKERWFLW		QVLNQQNIPQ		ISIVVDGGKK		VVEFMFQATE
GDVLNYIFRN		RELRPLFDRQ		WHKLGISIQS		QVISLYMDCN		LIARRQTDEK
DTVDFHGRTV		IATRASDGKP		VDIELHQLKI		YCSANLIAQE		TCCEISDTKC
PEQDGFGNIA		SSWVTAHASK		MSSYLPAKQE		LKDQCQCIPN		KGEAGLPGAP
GSPGQKGHKG		EPGENGLHGA		PGFPGQKGEQ		GFEGSKGETG		EKGEQGEKGD
PALAGLNGEN		GLKGDLGPHG		PPGPKGEKGD		TGPPGPPALP		GSLGIQGPQG
PPGKEGQRGR		RGKTGPPGKP		GPPGPPGPPG		IQGIHQTLGG		YYNKDNKGND
EHEAGGLKGD		KGETGLPGFP		GSVGPKGQKG		EPGEPFTKGE		KGDRGEPGVI
GSQGVKGEPG		DPGPPGLIGS		PGLKGQQGSA		GSMGPRGPPG		DVGLPGEHGI
PGKQGIKGEK		GDPGGIIGPP		GLPGPKGEAG		PPGKSLPGEP		GLDGNPGAPG
PRGPKGERGL		PGVHGSPGDI		GPQGIGIPGR		TGAQGPAGEP		GIQGPRGLPG
LPGTPGTPGN		DGVPGRDGKP		GLPGPPGDPI		ALPLLGDIGA		LLKNFCGNCQ
ASVPGLKSNK		GEEGGAGEPG		KYDSMARKGD		IGPRGPPGIP		GREGPKGSKG
ERGYPGIPGE		KGDEGLQGIP		GIPGAPGPTG		PPGLMGRTGH		PGPTGAKGEK
GSDGPPGKPG		PPGPPGIPFN		ERNGMSSLYK		IKGGVNVPSY		PGPPGPPGPK
GDPGPVGEPG		AMGLPGLEGF		PGVKGDRGPA		GPPGIAGMSG		KPGAPGPPGV
PGEPGERGPV		GDIGFPGPEG		PSGKPGINGK		DGIPGAQGIM		GKPGDRGPKG
ERGDQGIPGD		RGSQGERGKP		GLTGMKGAIG		PMGPPGNKGS		MGSPGHQGPP
GSPGIPGIPA		DAVSFEEIKK		YINQEVLRIF		EERMAVFLSQ		LKLPAAMLAA
QAYGRPGPPG		KDGLPGPPGD		PGPQGYRGQK		GERGEPGIGL		PGSPGLPGTS
ALGLPGSPGA		PGPQGPPGPS		GRCNPEDCLY		PVSHAHQRTG		GN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, диференціація клітин, міогенез. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Inoguchi K., Yoshioka H., Khaleduzzaman M., Ninomiya Y. (1995). The mRNA for alpha 1(XIX) collagen chain, a new member of FACITs, contains a long unusual 3' untranslated region and displays many unique splicing variants. J. Biochem. 117: 137—146. PMID 7775380

Див. також

• Хромосома 6