COL28A1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
COL28A1
Ідентифікатори
Символи COL28A1, COL28, collagen type XXVIII alpha 1, collagen type XXVIII alpha 1 chain
Зовнішні ІД OMIM: 609996 MGI: 2685312 HomoloGene: 66345 GeneCards: COL28A1
Пов'язані генетичні захворювання
натуральна віспа[1]
Реагує на сполуку
ocriplasmin[2]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001037763
NM_001037865
RefSeq (білок)
NP_001032852
NP_001032954
Локус (UCSC) Хр. 7: 7.36 – 7.54 Mb Хр. 6: 8 – 8.19 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL28A1 (англ. Collagen type XXVIII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 125 амінокислот, а молекулярна маса — 116 657[6].

Послідовність амінокислот
1020304050
MWNRYFVFYLLLLSAFTSQTVSGQRKKGPKSNLLARKSDVQGSICFIDIV
FIVDSSESSKIALFDKQKDFVDSLSDKIFQLTPGRSLEYDIKLAALQFSS
SVQIDPPFSSWKDLQTFKQKVKSMNLIGQGTFSYYAISNATRLLKREGRK
DGVKVVLLMTDGIDHPKNPDVQSISEDARISGISFITIALSTVVNEAKLR
LISGDSSSEPTLLLSDPTLVDKIQDRLDILFEKKCERKICECEKGDPGDP
GPPGTHGNPGIKGERGPKGNPGNAQKGEAGERGPGGIPGYKGDKGERGEC
GKPGIKGDKGSPGPYGPKGPRGIQGITGPPGDPGPKGFQGNKGEPGPPGP
YGSPGAPGIGQQGIKGERGQEGRPGAPGPIGVGEPGQPGPRGPEGVPGER
GLPGEGFPGPKGEKGSEGPTGPQGLQGLSIKGEKGDIGPVGPQGPMGIPG
IGSQGEQGIQGPIGPPGPQGPAGQGLPGSKGEVGQMGPTGPRGPVGIGVQ
GPKGEPGSIGLPGQPGVPGEDGAAGKKGEAGLPGARGPEGPPGKGQPGPK
GDEGKKGSKGNQGQRGLPGPEGPKGEPGIMGPFGMPGTSIPGPPGPKGDR
GGPGIPGFKGEPGLSIRGPKGVQGPRGPVGAPGLKGDGYPGVPGPRGLPG
PPGPMGLRGVGDTGAKGEPGVRGPPGPSGPRGVGTQGPKGDTGQKGLPGP
PGPPGYGSQGIKGEQGPQGFPGPKGTMGHGLPGQKGEHGERGDVGKKGDK
GEIGEPGSPGKQGLQGPKGDLGLTKEEIIKLITEICGCGPKCKETPLELV
FVIDSSESVGPENFQIIKNFVKTMADRVALDLATARIGIINYSHKVEKVA
NLKQFSSKDDFKLAVDNMQYLGEGTYTATALQAANDMFEDARPGVKKVAL
VITDGQTDSRDKEKLTEVVKNASDTNVEIFVIGVVKKNDPNFEIFHKEMN
LIATDPEHVYQFDDFFTLQDTLKQKLFQKICEDFDSYLVQIFGSSSPQPG
FGMSGEELSESTPEPQKEISESLSVTRDQDEDDKAPEPTWADDLPATTSS
EATTTPRPLLSTPVDGAEDPRCLEALKPGNCGEYVVRWYYDKQVNSCARF
WFSGCNGSGNRFNSEKECQETCIQG

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів серинових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. | ред. код]

Див. також

[ред. | ред. код]