COL9A2

COL9A2
Ідентифікатори
Символи	COL9A2, DJ39G22.4, EDM2, MED, STL5, collagen type IX alpha 2, collagen type IX alpha 2 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 120260 MGI: 88466 HomoloGene: 37535 GeneCards: COL9A2
Онтологія гена Молекулярна функція • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • extracellular region • endoplasmic reticulum lumen • колаген • collagen type IX trimer • базальна мембрана • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • skeletal system development • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1298	12840
Ensembl	ENSG00000049089	ENSMUSG00000028626
UniProt	Q14055	Q07643
RefSeq (мРНК)	NM_001852	NM_007741
RefSeq (білок)	NP_001843	NP_031767
Локус (UCSC)	Хр. 1: 40.3 – 40.32 Mb	Хр. 4: 120.9 – 120.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COL9A2 (англ. Collagen type IX alpha 2 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 689 амінокислот, а молекулярна маса — 65 131.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAATASPRS		LLVLLQVVVL		ALAQIRGPPG		ERGPPGPPGP		PGVPGSDGID
GDNGPPGKAG		PPGPKGEPGK		AGPDGPDGKP		GIDGLTGAKG		EPGPMGIPGV
KGQPGLPGPP		GLPGPGFAGP		PGPPGPVGLP		GEIGIRGPKG		DPGPDGPSGP
PGPPGKPGRP		GTIQGLEGSA		DFLCPTNCPP		GMKGPPGLQG		VKGHAGKRGI
LGDPGHQGKP		GPKGDVGASG		EQGIPGPPGP		QGIRGYPGMA		GPKGETGPHG
YKGMVGAIGA		TGPPGEEGPR		GPPGRAGEKG		DEGSPGIRGP		QGITGPKGAT
GPPGINGKDG		TPGTPGMKGS		AGQAGQPGSP		GHQGLAGVPG		QPGTKGGPGD
QGEPGPQGLP		GFSGPPGKEG		EPGPRGEIGP		QGIMGQKGDQ		GERGPVGQPG
PQGRQGPKGE		QGPPGIPGPQ		GLPGVKGDKG		SPGKTGPRGK		VGDPGVAGLP
GEKGEKGESG		EPGPKGQQGV		RGEPGYPGPS		GDAGAPGVQG		YPGPPGPRGL
AGNRGVPGQP		GRQGVEGRDA		TDQHIVDVAL		KMLQEQLAEV		AVSAKREALG
AVGMMGPPGP		PGPPGYPGKQ		GPHGHPGPRG		VPGIVGAVGQ		IGNTGPKGKR
GEKGDPGEVG		RGHPGMPGPP		GIPGLPGRPG		QAINGKDGDR		GSPGAPGEAG
RPGLPGPVGL		PGFCEPAACL		GASAYASARL		TEPGSIKGP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Peraelae M., Haenninen M., Haestbacka J., Elima K., Vuorio E. (1993). Molecular cloning of the human alpha 2(IX) collagen cDNA and assignment of the human COL9A2 gene to chromosome 1. FEBS Lett. 319: 177—180. PMID 8454052 DOI:10.1016/0014-5793(93)80062-Y

Див. також

• Хромосома 1