COL6A2
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
COL6A2 (англ. Collagen type VI alpha 2 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 019 амінокислот, а молекулярна маса — 108 579[6].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MLQGTCSVLL | LWGILGAIQA | QQQEVISPDT | TERNNNCPEK | TDCPIHVYFV | ||||
| LDTSESVTMQ | SPTDILLFHM | KQFVPQFISQ | LQNEFYLDQV | ALSWRYGGLH | ||||
| FSDQVEVFSP | PGSDRASFIK | NLQGISSFRR | GTFTDCALAN | MTEQIRQDRS | ||||
| KGTVHFAVVI | TDGHVTGSPC | GGIKLQAERA | REEGIRLFAV | APNQNLKEQG | ||||
| LRDIASTPHE | LYRNDYATML | PDSTEIDQDT | INRIIKVMKH | EAYGECYKVS | ||||
| CLEIPGPSGP | KGYRGQKGAK | GNMGEPGEPG | QKGRQGDPGI | EGPIGFPGPK | ||||
| GVPGFKGEKG | EFGADGRKGA | PGLAGKNGTD | GQKGKLGRIG | PPGCKGDPGN | ||||
| RGPDGYPGEA | GSPGERGDQG | GKGDPGRPGR | RGPPGEIGAK | GSKGYQGNSG | ||||
| APGSPGVKGA | KGGPGPRGPK | GEPGRRGDPG | TKGSPGSDGP | KGEKGDPGPE | ||||
| GPRGLAGEVG | NKGAKGDRGL | PGPRGPQGAL | GEPGKQGSRG | DPGDAGPRGD | ||||
| SGQPGPKGDP | GRPGFSYPGP | RGAPGEKGEP | GPRGPEGGRG | DFGLKGEPGR | ||||
| KGEKGEPADP | GPPGEPGPRG | PRGVPGPEGE | PGPPGDPGLT | ECDVMTYVRE | ||||
| TCGCCDCEKR | CGALDVVFVI | DSSESIGYTN | FTLEKNFVIN | VVNRLGAIAK | ||||
| DPKSETGTRV | GVVQYSHEGT | FEAIQLDDER | IDSLSSFKEA | VKNLEWIAGG | ||||
| TWTPSALKFA | YDRLIKESRR | QKTRVFAVVI | TDGRHDPRDD | DLNLRALCDR | ||||
| DVTVTAIGIG | DMFHEKHESE | NLYSIACDKP | QQVRNMTLFS | DLVAEKFIDD | ||||
| MEDVLCPDPQ | IVCPDLPCQT | ELSVAQCTQR | PVDIVFLLDG | SERLGEQNFH | ||||
| KARRFVEQVA | RRLTLARRDD | DPLNARVALL | QFGGPGEQQV | AFPLSHNLTA | ||||
| IHEALETTQY | LNSFSHVGAG | VVHAINAIVR | SPRGGARRHA | ELSFVFLTDG | ||||
| VTGNDSLHES | AHSMRKQNVV | PTVLALGSDV | DMDVLTTLSL | GDRAAVFHEK | ||||
| DYDSLAQPGF | FDRFIRWIC |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Jander R., Rauterberg J., Glanville R.W. (1983). Further characterization of the three polypeptide chains of bovine and human short-chain collagen (intima collagen). Eur. J. Biochem. 133: 39—46. PMID 6852033 DOI:10.1111/j.1432-1033.1983.tb07427.x
- Nishiyama A., Stallcup W.B. (1993). Expression of NG2 proteoglycan causes retention of type VI collagen on the cell surface. Mol. Biol. Cell. 4: 1097—1108. PMID 8305732 DOI:10.1091/mbc.4.11.1097
- Tillet E., Ruggiero F., Nishiyama A., Stallcup W.B. (1997). The membrane-spanning proteoglycan NG2 binds to collagens V and VI through the central nonglobular domain of its core protein. J. Biol. Chem. 272: 10769—10776. PMID 9099729 DOI:10.1074/jbc.272.16.10769
- Saitta B., Timpl R., Chu M.-L. (1992). Human alpha 2(VI) collagen gene. Heterogeneity at the 5'-untranslated region generated by an alternate exon. J. Biol. Chem. 267: 6188—6196. PMID 1556127
- Saitta B., Stokes D.G., Vissing H., Timpl R., Chu M.-L. (1990). Alternative splicing of the human alpha 2(VI) collagen gene generates multiple mRNA transcripts which predict three protein variants with distinct carboxyl termini. J. Biol. Chem. 265: 6473—6480. PMID 1690728
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL6A2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL6A2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2212 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
- ↑ UniProt, P12110 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.
|
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
