COL4A3

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
COL4A3
Ідентифікатори
Символи COL4A3, collagen type IV alpha 3 chain, ATS2, ATS3
Зовнішні ІД OMIM: 120070 MGI: 104688 HomoloGene: 68033 GeneCards: COL4A3
Реагує на сполуку
ocriplasmin[1]
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_007734
RefSeq (білок)
NP_000082
NP_031760
Локус (UCSC) Хр. 2: 227.16 – 227.31 Mb Хр. 1: 82.56 – 82.7 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL4A3 (англ. Collagen type IV alpha 3 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 670 амінокислот, а молекулярна маса — 161 813[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSARTAPRPQVLLLPLLLVLLAAAPAASKGCVCKDKGQCFCDGAKGEKGE
KGFPGPPGSPGQKGFTGPEGLPGPQGPKGFPGLPGLTGSKGVRGISGLPG
FSGSPGLPGTPGNTGPYGLVGVPGCSGSKGEQGFPGLPGTLGYPGIPGAA
GLKGQKGAPAKEEDIELDAKGDPGLPGAPGPQGLPGPPGFPGPVGPPGPP
GFFGFPGAMGPRGPKGHMGERVIGHKGERGVKGLTGPPGPPGTVIVTLTG
PDNRTDLKGEKGDKGAMGEPGPPGPSGLPGESYGSEKGAPGDPGLQGKPG
KDGVPGFPGSEGVKGNRGFPGLMGEDGIKGQKGDIGPPGFRGPTEYYDTY
QEKGDEGTPGPPGPRGARGPQGPSGPPGVPGSPGSSRPGLRGAPGWPGLK
GSKGERGRPGKDAMGTPGSPGCAGSPGLPGSPGPPGPPGDIVFRKGPPGD
HGLPGYLGSPGIPGVDGPKGEPGLLCTQCPYIPGPPGLPGLPGLHGVKGI
PGRQGAAGLKGSPGSPGNTGLPGFPGFPGAQGDPGLKGEKGETLQPEGQV
GVPGDPGLRGQPGRKGLDGIPGTPGVKGLPGPKGELALSGEKGDQGPPGD
PGSPGSPGPAGPAGPPGYGPQGEPGLQGTQGVPGAPGPPGEAGPRGELSV
STPVPGPPGPPGPPGHPGPQGPPGIPGSLGKCGDPGLPGPDGEPGIPGIG
FPGPPGPKGDQGFPGTKGSLGCPGKMGEPGLPGKPGLPGAKGEPAVAMPG
GPGTPGFPGERGNSGEHGEIGLPGLPGLPGTPGNEGLDGPRGDPGQPGPP
GEQGPPGRCIEGPRGAQGLPGLNGLKGQQGRRGKTGPKGDPGIPGLDRSG
FPGETGSPGIPGHQGEMGPLGQRGYPGNPGILGPPGEDGVIGMMGFPGAI
GPPGPPGNPGTPGQRGSPGIPGVKGQRGTPGAKGEQGDKGNPGPSEISHV
IGDKGEPGLKGFAGNPGEKGNRGVPGMPGLKGLKGLPGPAGPPGPRGDLG
STGNPGEPGLRGIPGSMGNMGMPGSKGKRGTLGFPGRAGRPGLPGIHGLQ
GDKGEPGYSEGTRPGPPGPTGDPGLPGDMGKKGEMGQPGPPGHLGPAGPE
GAPGSPGSPGLPGKPGPHGDLGFKGIKGLLGPPGIRGPPGLPGFPGSPGP
MGIRGDQGRDGIPGPAGEKGETGLLRAPPGPRGNPGAQGAKGDRGAPGFP
GLPGRKGAMGDAGPRGPTGIEGFPGPPGLPGAIIPGQTGNRGPPGSRGSP
GAPGPPGPPGSHVIGIKGDKGSMGHPGPKGPPGTAGDMGPPGRLGAPGTP
GLPGPRGDPGFQGFPGVKGEKGNPGFLGSIGPPGPIGPKGPPGVRGDPGT
LKIISLPGSPGPPGTPGEPGMQGEPGPPGPPGNLGPCGPRGKPGKDGKPG
TPGPAGEKGNKGSKGEPGPAGSDGLPGLKGKRGDSGSPATWTTRGFVFTR
HSQTTAIPSCPEGTVPLYSGFSFLFVQGNQRAHGQDLGTLGSCLQRFTTM
PFLFCNVNDVCNFASRNDYSYWLSTPALMPMNMAPITGRALEPYISRCTV
CEGPAIAIAVHSQTTDIPPCPHGWISLWKGFSFIMFTSAGSEGTGQALAS
PGSCLEEFRASPFLECHGRGTCNYYSNSYSFWLASLNPERMFRKPIPSTV
KAGELEKIISRCQVCMKKRH

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • Raya A., Revert F., Navarro S., Saus J. (1999). Characterization of a novel type of serine/threonine kinase that specifically phosphorylates the human goodpasture antigen. J. Biol. Chem. 274: 12642—12649. PMID 10212244 DOI:10.1074/jbc.274.18.12642
  • Maeshima Y., Colorado P.C., Kalluri R. (2000). Two RGD-independent alpha vbeta 3 integrin binding sites on tumstatin regulate distinct anti-tumor properties. J. Biol. Chem. 275: 23745—23750. PMID 10837460 DOI:10.1074/jbc.C000186200
  • Nagel M., Nagorka S., Gross O. (2005). Novel COL4A5, COL4A4, and COL4A3 mutations in Alport syndrome. Hum. Mutat. 26: 60—60. PMID 15954103 DOI:10.1002/humu.9349
  • Mariyama M., Leinonen A., Mochizuki T., Tryggvason K., Reeders S.T. (1994). Complete primary structure of the human alpha 3(IV) collagen chain. Coexpression of the alpha 3(IV) and alpha 4(IV) collagen chains in human tissues. J. Biol. Chem. 269: 23013—23017. PMID 8083201
  • Quinones S., Bernal D., Garcia-Sogo M., Elena S.F., Saus J. (1992). Exon/intron structure of the human alpha 3(IV) gene encompassing the Goodpasture antigen (alpha 3(IV)NC1). Identification of a potentially antigenic region at the triple helix/NC1 domain junction. J. Biol. Chem. 267: 19780—19784. PMID 1400291
  • Quinones S., Bernal D., Garcia-Sogo M., Elena S.F., Saus J. (1994). J. Biol. Chem. 269: 17358—17358. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 8006044

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з COL4A3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2204 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.
  5. UniProt, Q01955 (англ.) . Архів оригіналу за 20 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]