COL21A1

COL21A1
Ідентифікатори
Символи	COL21A1, collagen, type XXI, alpha 1, COLA1L, dJ682J15.1, dJ708F5.1, FP633, collagen type XXI alpha 1, collagen type XXI alpha 1 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 610002 HomoloGene: 49949 GeneCards: COL21A1
Онтологія гена Молекулярна функція • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength Клітинна компонента • цитоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • колаген • endoplasmic reticulum lumen • гіалоплазма • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • growth plate cartilage chondrocyte morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81578	100333837
Ensembl	ENSG00000124749	н/д
UniProt	Q96P44	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_030820 NM_001318751 NM_001318752 NM_001318753 NM_001318754	XM_002664080 XM_017358912 XM_017358915
RefSeq (білок)	NP_001305680 NP_001305681 NP_001305682 NP_001305683 NP_110447	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 56.06 – 56.39 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COL21A1 (англ. Collagen type XXI alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 957 амінокислот, а молекулярна маса — 99 369.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAHYITFLCM		VLVLLLQNSV		LAEDGEVRSS		CRTAPTDLVF		ILDGSYSVGP
ENFEIVKKWL		VNITKNFDIG		PKFIQVGVVQ		YSDYPVLEIP		LGSYDSGEHL
TAAVESILYL		GGNTKTGKAI		QFALDYLFAK		SSRFLTKIAV		VLTDGKSQDD
VKDAAQAARD		SKITLFAIGV		GSETEDAELR		AIANKPSSTY		VFYVEDYIAI
SKIREVMKQK		LCEESVCPTR		IPVAARDERG		FDILLGLDVN		KKVKKRIQLS
PKKIKGYEVT		SKVDLSELTS		NVFPEGLPPS		YVFVSTQRFK		VKKIWDLWRI
LTIDGRPQIA		VTLNGVDKIL		LFTTTSVING		SQVVTFANPQ		VKTLFDEGWH
QIRLLVTEQD		VTLYIDDQQI		ENKPLHPVLG		ILINGQTQIG		KYSGKEETVQ
FDVQKLRIYC		DPEQNNRETA		CEIPGFNGEC		LNGPSDVGST		PAPCICPPGK
PGLQGPKGDP		GLPGNPGYPG		QPGQDGKPGY		QGIAGTPGVP		GSPGIQGARG
LPGYKGEPGR		DGDKGDRGLP		GFPGLHGMPG		SKGEMGAKGD		KGSPGFYGKK
GAKGEKGNAG		FPGLPGPAGE		PGRHGKDGLM		GSPGFKGEAG		SPGAPGQDGT
RGEPGIPGFP		GNRGLMGQKG		EIGPPGQQGK		KGAPGMPGLM		GSNGSPGQPG
TPGSKGSKGE		PGIQGMPGAS		GLKGEPGATG		SPGEPGYMGL		PGIQGKKGDK
GNQGEKGIQG		QKGENGRQGI		PGQQGIQGHH		GAKGERGEKG		EPGVRGAIGS
KGESGVDGLM		GPAGPKGQPG		DPGPQGPPGL		DGKPGREFSE		QFIRQVCTDV
IRAQLPVLLQ		SGRIRNCDHC		LSQHGSPGIP		GPPGPIGPEG		PRGLPGLPGR
DGVPGLVGVP		GRPGVRGLKG		LPGRNGEKGS		QGFGYPGEQG		PPGPPGPEGP
PGISKEGPPG		DPGLPGKDGD		HGKPGIQGQP		GPPGICDPSL		CFSVIARRDP
FRKGPNY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Fitzgerald J., Bateman J.F. (2001). A new FACIT of the collagen family: COL21A1. FEBS Lett. 505: 275—280. PMID 11566190 DOI:10.1016/S0014-5793(01)02754-5
• Chou M.-Y., Li H.-C. (2002). Genomic organization and characterization of the human type XXI collagen (COL21A1) gene. Genomics. 79: 395—401. PMID 11863369 DOI:10.1006/geno.2002.6712
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6