COMP

COMP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3FBY
Ідентифікатори
Символи	COMP, EDM1, EPD1, MED, PSACH, THBS5, cartilage oligomeric matrix protein, TSP5, CTS2
Зовнішні ІД	OMIM: 600310 MGI: 88469 HomoloGene: 74 GeneCards: COMP
Пов'язані генетичні захворювання
pseudoachondroplasia
Онтологія гена Молекулярна функція • protease binding • calcium ion binding • heparan sulfate proteoglycan binding • heparin binding • extracellular matrix structural constituent • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • collagen binding • integrin binding • BMP binding • proteoglycan binding Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • екзосома • міжклітинний простір • extracellular region • GO:0009327 protein-containing complex • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • animal organ morphogenesis • growth plate cartilage development • skeletal system development • адгезія клітин • extracellular matrix organization • negative regulation of apoptotic process • limb development • GO:0097285 апоптоз • осифікація • chondrocyte development • endochondral bone growth • response to unfolded protein • зсідання крові • protein secretion • multicellular organism aging • регуляція експресії генів • vascular associated smooth muscle contraction • protein processing • collagen fibril organization • bone mineralization • regulation of bone mineralization • BMP signaling pathway • multicellular organism growth • chondrocyte proliferation • tendon development • skin development • artery morphogenesis • musculoskeletal movement • neuromuscular process • cartilage development • bone morphogenesis • platelet aggregation • vascular associated smooth muscle cell development • bone growth • negative regulation of hemostasis • positive regulation of chondrocyte proliferation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1311	12845
Ensembl	ENSG00000105664	ENSMUSG00000031849
UniProt	P49747	Q9R0G6
RefSeq (мРНК)	NM_000095	NM_016685
RefSeq (білок)	NP_000086	NP_057894
Локус (UCSC)	Хр. 19: 18.78 – 18.79 Mb	Хр. 8: 70.83 – 70.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COMP (англ. Cartilage oligomeric matrix protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 757 амінокислот, а молекулярна маса — 82 860.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVPDTACVLL		LTLAALGASG		QGQSPLGSDL		GPQMLRELQE		TNAALQDVRE
LLRQQVREIT		FLKNTVMECD		ACGMQQSVRT		GLPSVRPLLH		CAPGFCFPGV
ACIQTESGAR		CGPCPAGFTG		NGSHCTDVNE		CNAHPCFPRV		RCINTSPGFR
CEACPPGYSG		PTHQGVGLAF		AKANKQVCTD		INECETGQHN		CVPNSVCINT
RGSFQCGPCQ		PGFVGDQASG		CQRRAQRFCP		DGSPSECHEH		ADCVLERDGS
RSCVCAVGWA		GNGILCGRDT		DLDGFPDEKL		RCPERQCRKD		NCVTVPNSGQ
EDVDRDGIGD		ACDPDADGDG		VPNEKDNCPL		VRNPDQRNTD		EDKWGDACDN
CRSQKNDDQK		DTDQDGRGDA		CDDDIDGDRI		RNQADNCPRV		PNSDQKDSDG
DGIGDACDNC		PQKSNPDQAD		VDHDFVGDAC		DSDQDQDGDG		HQDSRDNCPT
VPNSAQEDSD		HDGQGDACDD		DDDNDGVPDS		RDNCRLVPNP		GQEDADRDGV
GDVCQDDFDA		DKVVDKIDVC		PENAEVTLTD		FRAFQTVVLD		PEGDAQIDPN
WVVLNQGREI		VQTMNSDPGL		AVGYTAFNGV		DFEGTFHVNT		VTDDDYAGFI
FGYQDSSSFY		VVMWKQMEQT		YWQANPFRAV		AEPGIQLKAV		KSSTGPGEQL
RNALWHTGDT		ESQVRLLWKD		PRNVGWKDKK		SYRWFLQHRP		QVGYIRVRFY
EGPELVADSN		VVLDTTMRGG		RLGVFCFSQE		NIIWANLRYR		CNDTIPEDYE
THQLRQA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, з молекулою гепарину. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chen H., Deere M., Hecht J.T., Lawler J. (2000). Cartilage oligomeric matrix protein is a calcium-binding protein, and a mutation in its type 3 repeats causes conformational changes. J. Biol. Chem. 275: 26538—26544. PMID 10852928 DOI:10.1074/jbc.M909780199
• Mann H.H., Oezbek S., Engel J., Paulsson M., Wagener R. (2004). Interactions between the cartilage oligomeric matrix protein and matrilins. Implications for matrix assembly and the pathogenesis of chondrodysplasias. J. Biol. Chem. 279: 25294—25298. PMID 15075323 DOI:10.1074/jbc.M403778200
• Chen F.-H., Thomas A.O., Hecht J.T., Goldring M.B., Lawler J. (2005). Cartilage oligomeric matrix protein/thrombospondin 5 supports chondrocyte attachment through interaction with integrins. J. Biol. Chem. 280: 32655—32661. PMID 16051604 DOI:10.1074/jbc.M504778200
• Koelling S., Clauditz T.S., Kaste M., Miosge N. (2006). Cartilage oligomeric matrix protein is involved in human limb development and in the pathogenesis of osteoarthritis. Arthritis Res. Ther. 8: R56—R56. PMID 16542502 DOI:10.1186/ar1922
• Gagarina V., Carlberg A.L., Pereira-Mouries L., Hall D.J. (2008). Cartilage oligomeric matrix protein protects cells against death by elevating members of the IAP family of survival proteins. J. Biol. Chem. 283: 648—659. PMID 17993464 DOI:10.1074/jbc.M704035200

Див. також

• Хромосома 19