COMP

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
COMP
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи COMP, EDM1, EPD1, MED, PSACH, THBS5, cartilage oligomeric matrix protein, TSP5, CTS2
Зовнішні ІД OMIM: 600310 MGI: 88469 HomoloGene: 74 GeneCards: COMP
Пов'язані генетичні захворювання
pseudoachondroplasia[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_000095
NM_016685
RefSeq (білок)
NP_000086
NP_057894
Локус (UCSC) Хр. 19: 18.78 – 18.79 Mb Хр. 8: 70.83 – 70.83 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COMP (англ. Cartilage oligomeric matrix protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 757 амінокислот, а молекулярна маса — 82 860[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MVPDTACVLLLTLAALGASGQGQSPLGSDLGPQMLRELQETNAALQDVRE
LLRQQVREITFLKNTVMECDACGMQQSVRTGLPSVRPLLHCAPGFCFPGV
ACIQTESGARCGPCPAGFTGNGSHCTDVNECNAHPCFPRVRCINTSPGFR
CEACPPGYSGPTHQGVGLAFAKANKQVCTDINECETGQHNCVPNSVCINT
RGSFQCGPCQPGFVGDQASGCQRRAQRFCPDGSPSECHEHADCVLERDGS
RSCVCAVGWAGNGILCGRDTDLDGFPDEKLRCPERQCRKDNCVTVPNSGQ
EDVDRDGIGDACDPDADGDGVPNEKDNCPLVRNPDQRNTDEDKWGDACDN
CRSQKNDDQKDTDQDGRGDACDDDIDGDRIRNQADNCPRVPNSDQKDSDG
DGIGDACDNCPQKSNPDQADVDHDFVGDACDSDQDQDGDGHQDSRDNCPT
VPNSAQEDSDHDGQGDACDDDDDNDGVPDSRDNCRLVPNPGQEDADRDGV
GDVCQDDFDADKVVDKIDVCPENAEVTLTDFRAFQTVVLDPEGDAQIDPN
WVVLNQGREIVQTMNSDPGLAVGYTAFNGVDFEGTFHVNTVTDDDYAGFI
FGYQDSSSFYVVMWKQMEQTYWQANPFRAVAEPGIQLKAVKSSTGPGEQL
RNALWHTGDTESQVRLLWKDPRNVGWKDKKSYRWFLQHRPQVGYIRVRFY
EGPELVADSNVVLDTTMRGGRLGVFCFSQENIIWANLRYRCNDTIPEDYE
THQLRQA

Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, з молекулою гепарину. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Chen H., Deere M., Hecht J.T., Lawler J. (2000). Cartilage oligomeric matrix protein is a calcium-binding protein, and a mutation in its type 3 repeats causes conformational changes. J. Biol. Chem. 275: 26538—26544. PMID 10852928 DOI:10.1074/jbc.M909780199
  • Mann H.H., Oezbek S., Engel J., Paulsson M., Wagener R. (2004). Interactions between the cartilage oligomeric matrix protein and matrilins. Implications for matrix assembly and the pathogenesis of chondrodysplasias. J. Biol. Chem. 279: 25294—25298. PMID 15075323 DOI:10.1074/jbc.M403778200
  • Chen F.-H., Thomas A.O., Hecht J.T., Goldring M.B., Lawler J. (2005). Cartilage oligomeric matrix protein/thrombospondin 5 supports chondrocyte attachment through interaction with integrins. J. Biol. Chem. 280: 32655—32661. PMID 16051604 DOI:10.1074/jbc.M504778200
  • Koelling S., Clauditz T.S., Kaste M., Miosge N. (2006). Cartilage oligomeric matrix protein is involved in human limb development and in the pathogenesis of osteoarthritis. Arthritis Res. Ther. 8: R56—R56. PMID 16542502 DOI:10.1186/ar1922
  • Gagarina V., Carlberg A.L., Pereira-Mouries L., Hall D.J. (2008). Cartilage oligomeric matrix protein protects cells against death by elevating members of the IAP family of survival proteins. J. Biol. Chem. 283: 648—659. PMID 17993464 DOI:10.1074/jbc.M704035200

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з COMP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2227 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
  5. UniProt, P49747 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]