Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
CEBPG
Ідентифікатори
Символи
CEBPG , GPE1BP, IG/EBP-1, CCAAT/enhancer binding protein gamma, CCAAT enhancer binding protein gamma
Зовнішні ІД
OMIM : 138972 MGI: 104982 HomoloGene: 1368 GeneCards: CEBPG
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • sequence-specific DNA binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • double-stranded DNA binding • RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding, bending
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1900404 positive regulation of DNA repair • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • enucleate erythrocyte differentiation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • mRNA metabolic process • B cell differentiation • positive regulation of DNA binding • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • natural killer cell mediated cytotoxicity • transcription by RNA polymerase II • liver development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 33.37 – 33.38 Mb
Хр. 7: 34.75 – 34.76 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
CEBPG (англ. CCAAT/enhancer binding protein gamma ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 150 амінокислот , а молекулярна маса — 16 408[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSKISQQNST PGVNGISVIH TQAHASGLQQ VPQLVPAGPG GGGKAVAPSK
QSKKSSPMDR NSDEYRQRRE RNNMAVKKSR LKSKQKAQDT LQRVNQLKEE
NERLEAKIKL LTKELSVLKD LFLEHAHNLA DNVQSISTEN TTADGDNAGQ
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші