Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ZNF655
Ідентифікатори
Символи
ZNF655 , VIK, VIK-1, zinc finger protein 655
Зовнішні ІД
OMIM : 617891 MGI: 1919861 HomoloGene: 12473 GeneCards: ZNF655
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • молекулярна функція • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • ядерце • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 99.56 – 99.58 Mb
Хр. 5: 145.17 – 145.18 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
ZNF655 (англ. Zinc finger protein 655 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 491 амінокислот , а молекулярна маса — 57 407[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEEIPAQEAA GSPRVQFQSL ETQSECLSPE PQFVQDTDME QGLTGDGETR
EENKLLIPKQ KISEEVHSYK VRVGRLKHDI TQVPETREVY KSEDRLERLQ
EILRKFLYLE REFRQITISK ETFTSEKNNE CHEPEKSFSL DSTIDADQRV
LRIQNTDDND KYDMSFNQNS ASGKHEHLNL TEDFQSSECK ESLMDLSHLN
KWESIPNTEK SYKCDVCGKI FHQSSALTRH QRIHTREKPY KCKECEKSFS
QSSSLSRHKR IHTREKPYKC EASDKSCEAS DKSCSPSSGI IQHKKIHTRA
KSYKCSSCER VFSRSVHLTQ HQKIHKEMPC KCTVCGSDFC HTSYLLEHQR
VHHEEKAYEY DEYGLAYIKQ QGIHFREKPY TCSECGKDFR LNSHLIQHQR
IHTGEKAHEC NECGKAFSQT SCLIQHHKMH RKEKSYECNE YEGSFSHSSD
LILQQEVLTR QKAFDCDVWE KNSSQRAHLV QHQSIHTKEN S
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші