Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NFE2L1
Ідентифікатори
Символи
NFE2L1 , LCR-F1, NRF1, TCF11, nuclear factor, erythroid 2 like 1, NRF-1, NFE2 like bZIP transcription factor 1
Зовнішні ІД
OMIM : 163260 MGI: 99421 HomoloGene: 20685 GeneCards: NFE2L1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001104 transcription coregulator activity • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • cholesterol binding • protein heterodimerization activity • lipid binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • promoter-specific chromatin binding
Клітинна компонента
• integral component of membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • integral component of endoplasmic reticulum membrane • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • heme biosynthetic process • erythrocyte differentiation • inflammatory response • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • cellular response to oxidative stress • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress • cell redox homeostasis • lipid homeostasis • cellular response to cholesterol • negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress • regulation of odontoblast differentiation • lipid metabolism • steroid metabolic process • cholesterol metabolic process • cholesterol homeostasis • protein polyubiquitination • fructose 6-phosphate metabolic process • glutathione metabolic process • regulation of mitotic nuclear division • регуляція експресії генів • regulation of glucose metabolic process • regulation of lipid metabolic process • regulation of fatty acid metabolic process • cellular homeostasis • spinal cord motor neuron differentiation • glial cell fate commitment • response to endoplasmic reticulum stress • cysteine transport • regulation of inflammatory response • glucose 6-phosphate metabolic process • regulation of proteasomal protein catabolic process • cellular response to cold • regulation of nucleus organization • regulation of response to endoplasmic reticulum stress
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 48.05 – 48.06 Mb
Хр. 11: 96.71 – 96.72 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NFE2L1 (англ. Nuclear factor, erythroid 2 like 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 772 амінокислот , а молекулярна маса — 84 704[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLSLKKYLTE GLLQFTILLS LIGVRVDVDT YLTSQLPPLR EIILGPSSAY
TQTQFHNLRN TLDGYGIHPK SIDLDNYFTA RRLLSQVRAL DRFQVPTTEV
NAWLVHRDPE GSVSGSQPNS GLALESSSGL QDVTGPDNGV RESETEQGFG
EDLEDLGAVA PPVSGDLTKE DIDLIDILWR QDIDLGAGRE VFDYSHRQKE
QDVEKELRDG GEQDTWAGEG AEALARNLLV DGETGESFPA QVPSGEDQTA
LSLEECLRLL EATCPFGENA EFPADISSIT EAVPSESEPP ALQNNLLSPL
LTGTESPFDL EQQWQDLMSI MEMQAMEVNT SASEILYSAP PGDPLSTNYS
LAPNTPINQN VSLHQASLGG CSQDFLLFSP EVESLPVASS STLLPLAPSN
STSLNSTFGS TNLTGLFFPP QLNGTANDTA GPELPDPLGG LLDEAMLDEI
SLMDLAIEEG FNPVQASQLE EEFDSDSGLS LDSSHSPSSL SSSEGSSSSS
SSSSSSSSSA SSSASSSFSE EGAVGYSSDS ETLDLEEAEG AVGYQPEYSK
FCRMSYQDPA QLSCLPYLEH VGHNHTYNMA PSALDSADLP PPSALKKGSK
EKQADFLDKQ MSRDEHRARA MKIPFTNDKI INLPVEEFNE LLSKYQLSEA
QLSLIRDIRR RGKNKMAAQN CRKRKLDTIL NLERDVEDLQ RDKARLLREK
VEFLRSLRQM KQKVQSLYQE VFGRLRDENG RPYSPSQYAL QYAGDGSVLL
IPRTMADQQA RRQERKPKDR RK
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі , мембрані, ендоплазматичному ретикулумі .
Chan J.Y., Han X.-L., Kan Y.W. (1993). Cloning of Nrf1, an NF-E2-related transcription factor, by genetic selection in yeast. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 90 : 11371—11375. PMID 8248256 DOI :10.1073/pnas.90.23.11371
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Caterina J.J., Donze D., Sun C.W., Ciavatta D.J., Townes T.M. (1994). Cloning and functional characterization of LCR-F1: a bZIP transcription factor that activates erythroid-specific, human globin gene expression. Nucleic Acids Res . 22 : 2383—2391. PMID 8036168 DOI :10.1093/nar/22.12.2383
Wang W., Chan J.Y. (2006). Nrf1 is targeted to the endoplasmic reticulum membrane by an N-terminal transmembrane domain. Inhibition of nuclear translocation and transacting function. J. Biol. Chem . 281 : 19676—19687. PMID 16687406 DOI :10.1074/jbc.M602802200
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші