RB (білок)

RB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1AD6, 1GH6, 1GUX, 1H25, 1N4M, 1O9K, 1PJM, 2AZE, 2QDJ, 2R7G, 3N5U, 3POM, 4ELJ, 4ELL, 4CRI
Ідентифікатори
Символи	RB1, pRb, RB, retinoblastoma 1, OSRC, PPP1R130, p105-Rb, pp110, Retinoblastoma protein, RB transcriptional corepressor 1, p110-RB1
Зовнішні ІД	OMIM: 614041 MGI: 97874 HomoloGene: 272 GeneCards: RB1
Пов'язані генетичні захворювання
рак сечового міхура, lung small cell carcinoma, familial retinoblastoma
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • transcription factor binding • phosphoprotein binding • kinase binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • androgen receptor binding • identical protein binding • enzyme binding • ubiquitin protein ligase binding • importin-alpha family protein binding • disordered domain specific binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • PML body • SWI/SNF complex • transcription regulator complex • веретено поділу • cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex • Хроматин • клітинне ядро • нуклеоплазма • Rb-E2F complex Біологічний процес • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of mitotic cell cycle • neuron apoptotic process • androgen receptor signaling pathway • ремоделювання хроматину • negative regulation of smoothened signaling pathway • negative regulation of protein kinase activity • cell morphogenesis involved in neuron differentiation • mitotic cell cycle checkpoint signaling • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of macrophage differentiation • cellular response to xenobiotic stimulus • negative regulation of cell cycle • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • transcription, DNA-templated • glial cell apoptotic process • regulation of cohesin loading • regulation of cell cycle • neuron maturation • поділ клітини • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • positive regulation of mitotic metaphase/anaphase transition • GO:1903097, GO:1903098, GO:1903099 regulation of centromere complex assembly • enucleate erythrocyte differentiation • neuron differentiation • regulation of mitotic cell cycle • negative regulation of epithelial cell proliferation • skeletal muscle cell differentiation • sister chromatid biorientation • protein localization to chromosome, centromeric region • клітинний цикл • striated muscle cell differentiation • Ras protein signal transduction • myoblast differentiation • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • neuron projection development • digestive tract development • maintenance of mitotic sister chromatid cohesion • regulation of lipid kinase activity • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • hepatocyte apoptotic process • GO:0097285 апоптоз • positive regulation of transcription regulatory region DNA binding • negative regulation of gene expression • regulation of cell growth • tissue homeostasis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • G1/S transition of mitotic cell cycle • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • aortic valve morphogenesis • negative regulation of inflammatory response • positive regulation of extracellular matrix organization • positive regulation of collagen fibril organization • negative regulation of myofibroblast differentiation • диференціація клітин • negative regulation of cold-induced thermogenesis • negative regulation of protein serine/threonine kinase activity • negative regulation of tau-protein kinase activity • negative regulation of apoptotic signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5925	19645
Ensembl	ENSG00000139687	ENSMUSG00000022105
UniProt	P06400	P13405
RefSeq (мРНК)	NM_000321	NM_009029
RefSeq (білок)	NP_000312 NP_000312.2	NP_033055
Локус (UCSC)	Хр. 13: 48.3 – 48.6 Mb	Хр. 14: 73.42 – 73.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RB, білок ретинобластоми (англ. RB transcriptional corepressor 1) — білок, який кодується геном супресором пухлин RB1, розташованим у людини на довгому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 928 амінокислот, а молекулярна маса — 106 159. Уперше виявлений під час вивчення спадкової форми раку сітківки у дітей — ретинобластоми, через що й отримав свою назву. Його функцією є стримання клітинного циклу, зокрема проходження через точку контролю G₁/S. Проте втрата обидвох робочих копій гена Rb не одразу призводить до надмірної проліферації й виникнення пухлин сітківки та інших тканин, оскільки існують допоміжні механізми зупинки клітинного циклу в тій же фазі.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPPKTPRKTA		ATAAAAAAEP		PAPPPPPPPE		EDPEQDSGPE		DLPLVRLEFE
ETEEPDFTAL		CQKLKIPDHV		RERAWLTWEK		VSSVDGVLGG		YIQKKKELWG
ICIFIAAVDL		DEMSFTFTEL		QKNIEISVHK		FFNLLKEIDT		STKVDNAMSR
LLKKYDVLFA		LFSKLERTCE		LIYLTQPSSS		ISTEINSALV		LKVSWITFLL
AKGEVLQMED		DLVISFQLML		CVLDYFIKLS		PPMLLKEPYK		TAVIPINGSP
RTPRRGQNRS		ARIAKQLEND		TRIIEVLCKE		HECNIDEVKN		VYFKNFIPFM
NSLGLVTSNG		LPEVENLSKR		YEEIYLKNKD		LDARLFLDHD		KTLQTDSIDS
FETQRTPRKS		NLDEEVNVIP		PHTPVRTVMN		TIQQLMMILN		SASDQPSENL
ISYFNNCTVN		PKESILKRVK		DIGYIFKEKF		AKAVGQGCVE		IGSQRYKLGV
RLYYRVMESM		LKSEEERLSI		QNFSKLLNDN		IFHMSLLACA		LEVVMATYSR
STSQNLDSGT		DLSFPWILNV		LNLKAFDFYK		VIESFIKAEG		NLTREMIKHL
ERCEHRIMES		LAWLSDSPLF		DLIKQSKDRE		GPTDHLESAC		PLNLPLQNNH
TAADMYLSPV		RSPKKKGSTT		RVNSTANAET		QATSAFQTQK		PLKSTSLSLF
YKKVYRLAYL		RLNTLCERLL		SEHPELEHII		WTLFQHTLQN		EYELMRDRHL
DQIMMCSMYG		ICKVKNIDLK		FKIIVTAYKD		LPHAVQETFK		RVLIKEEEYD
SIIVFYNSVF		MQRLKTNILQ		YASTRPPTLS		PIPHIPRSPY		KFPSSPLRIP
GGNIYISPLK		SPYKISEGLP		TPTKMTPRSR		ILVSIGESFG		TSEKFQKINQ
MVCNSDRVLK		RSAEGSNPPK		PLKKLRFDIE		GSDEADGSKH		LPGESKFQQK
LAEMTSTRTR		MQKQKMNDSM		DTSNKEEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, регуляція транскрипції, ацетилювання та метилювання хроматину. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Функція

Білок Rb виконує свою функцію шляхом зв'язування та інактивації групи транскрипційних факторів E2F. Ці білки в активному стані приєднуються до специфічних послідовностей у промоторних ділянках широкого спектра генів, продукти яких необхідні для проходження S-фази клітинного циклу, зокрема такі як G₁/S-цикліни, S-цикліни, ферменти та інші білки, необхідні для реплікації ДНК і подвоєння хромосом. За браку мітогенних стимулів Rb пригнічує активність білків E2F і не пропускає клітину в S-фазу.

Коли клітина отримує сигнал, який спонукає її до поділу, у ній накопичуються G₁-циклін-залежні кінази, які фосфорилюють Rb і переводять його в неактивну форму. У такому разі інгібування знімається із факторів транскрипції E2F, і вони можуть запускати S-фазу.

Роль у пухлинах

Ген Rb був виявлений під час вивчення рідкісного спадкового захворювання — ретинобластоми. Для деяких особин з цією хворобою, характерний візуально аномальний каріотип: у них бракує однієї специфічної смуги на 13-й хромосомі. Делеція тієї ж ділянки спостерігається у деяких пацієнтів із неспадковою формою захворювання. Ці дані дозволили клонувати ген Rb. Було з'ясовано, що в людей, уражених спадковою формою ретинобластоми, цей ген делетований або в ньому відбулась мутація, яка призвела до втрати функції, в одній із двох копій 13-ї хромосоми в кожній соматичній клітині. Такі клітини є більш схильними до злоякісного переродження, проте воно відбувається тільки в разі інактивації нормальної копії гена Rb. Це може статися шляхом втрати однієї хромосоми з подальшою дуплікацією хромосоми із мутантним або делетованим геном, мітотичної рекомбінації, конверсії генів, делеції або точкової мутації. Такі події трапляються з частотою, що дозволяє незалежне виникнення великої кількості пухлин в обидвох очах.

Неспадкова форма ретинобластоми трапляється дуже рідко, оскільки для її виникнення необхідна інактивація обидвох нормальних копій гена Rb. При цьому виникає тільки одна пухлина в одному оці. Функціонального Rb також бракує у кількох інших типах ракових захворювань, зокрема карциномах легень, молочної залози, сечового міхура. Ці злоякісні пухлини виникають внаслідок складнішої серії генетичних змін ніж ретинобластома і з'являються пізніше у житті людини. У багатьох інших типах злоякісних новоутворень сигнальний шлях Rb інактивується через зміни в роботі інших його компонентів.

Джерела

• Alberts B, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P (2007). Molecular Biology of the Cell (вид. 5th). Garland Science. ISBN 978-0-8153-4105-5. Архів оригіналу за 22 липня 2011. Процитовано 12 листопада 2012.

Література

• McGee T.L., Yandell D.W., Dryja T.P. (1989). Structure and partial genomic sequence of the human retinoblastoma susceptibility gene. Gene. 80: 119—128. PMID 2701949 DOI:10.1016/0378-1119(89)90256-4
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lohmann D.R., Brandt B., Hopping W., Passarge E., Horsthemke B. (1994). Spectrum of small length germline mutations in the RB1 gene. Hum. Mol. Genet. 3: 2187—2193. PMID 7881418 DOI:10.1093/hmg/3.12.2187
• Meyerson M., Harlow E. (1994). Identification of G1 kinase activity for cdk6, a novel cyclin D partner. Mol. Cell. Biol. 14: 2077—2086. PMID 8114739 DOI:10.1128/MCB.14.3.2077
• Durfee T., Mancini M.A., Jones D., Elledge S.J., Lee W.H. (1994). The amino-terminal region of the retinoblastoma gene product binds a novel nuclear matrix protein that co-localizes to centers for RNA processing. J. Cell Biol. 127: 609—622. PMID 7525595 DOI:10.1083/jcb.127.3.609
• Kim Y.W., Otterson G.A., Kratzke R.A., Coxon A.B., Kaye F.J. (1994). Differential specificity for binding of retinoblastoma binding protein 2 to RB, p107, and TATA-binding protein. Mol. Cell. Biol. 14: 7256—7264. PMID 7935440 DOI:10.1128/MCB.14.11.7256

Див. також

• Хромосома 13