NR6A1

NR6A1
Ідентифікатори
Символи	NR6A1, CT150, GCNF, GCNF1, NR61, RTR, hGCNF, hRTR, nuclear receptor subfamily 6 group A member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602778 MGI: 1352459 HomoloGene: 36308 GeneCards: NR6A1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • protein homodimerization activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • zinc ion binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • зв'язування з іоном металу; • steroid hormone receptor activity; • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• нуклеоплазма; • клітинне ядро; • transcription regulator complex;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • gamete generation; • Сперматогенез; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • проліферація; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • intracellular steroid hormone receptor signaling pathway; • intracellular receptor signaling pathway; • steroid hormone mediated signaling pathway; • transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	2649
	14536
	ENSG00000148200
	ENSMUSG00000063972
	Q15406
	Q64249
	NM_001278546; NM_001489; NM_033334; NM_033335
	NM_001159548; NM_001159549; NM_010264
	NP_001265475; NP_001480; NP_201591; NP_201591.2
	NP_001153020; NP_001153021; NP_034394
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NR6A1 (англ. Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 480 амінокислот, а молекулярна маса — 54 383^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MERDEPPPSG	GGGGGGSAGF	LEPPAALPPP	PRNGFCQDEL	AELDPGTISV
SDDRAEQRTC	LICGDRATGL	HYGIISCEGC	KGFFKRSICN	KRVYRCSRDK
NCVMSRKQRN	RCQYCRLLKC	LQMGMNRKAI	REDGMPGGRN	KSIGPVQISE
EEIERIMSGQ	EFEEEANHWS	NHGDSDHSSP	GNRASESNQP	SPGSTLSSSR
SVELNGFMAF	REQYMGMSVP	PHYQYIPHLF	SYSGHSPLLP	QQARSLDPQS
YSLIHQLLSA	EDLEPLGTPM	LIEDGYAVTQ	AELFALLCRL	ADELLFRQIA
WIKKLPFFCE	LSIKDYTCLL	SSTWQELILL	SSLTVYSKQI	FGELADVTAK
YSPSDEELHR	FSDEGMEVIE	RLIYLYHKFH	QLKVSNEEYA	CMKAINFLNQ
DIRGLTSASQ	LEQLNKRYWY	ICQDFTEYKY	THQPNRFPDL	MMCLPEIRYI
AGKMVNVPLE	QLPLLFKVVL	HSCKTSVGKE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Kapelle M., Kraetzschmar J., Husemann M., Schleuning W.-D. (1997). cDNA cloning of two closely related forms of human germ cell nuclear factor (GCNF). Biochim. Biophys. Acta. 1352: 13—17. PMID 9177477 doi:10.1016/S0167-4781(97)00043-2
Agoulnik I.Y., Cho Y., Niederberger C., Kieback D.G., Cooney A.J. (1998). Cloning, expression analysis and chromosomal localization of the human nuclear receptor gene GCNF. FEBS Lett. 424: 73—78. PMID 9537518 doi:10.1016/S0014-5793(98)00142-2
Schneider-Hirsch S., Bauer U.M., Heiermann R., Rentrop M., Maelicke A. (1998). Cloning of the human NCNF gene. J. Recept. Signal Transduct. 18: 1—13. PMID 9493564 doi:10.3109/10799899809039161
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Yan Z., Kim Y.-S., Jetten A.M. (2002). RAP80: a novel nuclear protein that interacts with the retinoid-related testis-associated receptor. J. Biol. Chem. 277: 32379—32388. PMID 12080054 doi:10.1074/jbc.M203475200
Suesens U., Borgmeyer U. (1996). Characterization of the human germ cell nuclear factor gene. Biochim. Biophys. Acta. 1309: 179—182. PMID 8982251

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7985 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q15406 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.