RARG

RARG
Наявні структури PDB Пошук ортологів: H3BMH6 PDBe H3BMH6 RCSB Список кодів PDB 1EXA, 1EXX, 1FCX, 1FCY, 1FCZ, 1FD0, 2LBD, 3LBD, 4LBD
Ідентифікатори
Символи	RARG, NR1B3, RARC, retinoic acid receptor gamma, RARgamma
Зовнішні ІД	OMIM: 180190 MGI: 97858 HomoloGene: 20263 GeneCards: RARG
Реагує на сполуку
adapalene, alitretinoin, palovarotene, tamibarotene, tazarotene, третиноїн
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • steroid hormone receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • retinoid X receptor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • transcription factor binding • nuclear receptor coactivator activity • signaling receptor activity • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • нуклеоплазма • клітинне ядро • transcription regulator complex • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • regulation of cell size • growth plate cartilage development • cellular response to retinoic acid • gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of cartilage development • response to retinoic acid • multicellular organism growth • negative regulation of cell differentiation • bone morphogenesis • chondrocyte development • negative regulation of apoptotic process • retinal pigment epithelium development • transcription, DNA-templated • epithelium development • embryonic camera-type eye development • reproductive structure development • limb development • face development • neural tube closure • negative regulation of chondrocyte differentiation • Harderian gland development • prostate gland epithelium morphogenesis • regulation of myelination • GO:1901313 positive regulation of gene expression • retina development in camera-type eye • positive regulation of cell population proliferation • growth plate cartilage chondrocyte growth • canonical Wnt signaling pathway • регуляція експресії генів • camera-type eye development • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • regulation of myeloid cell differentiation • bone development • trachea cartilage development • anterior/posterior pattern specification • glandular epithelial cell development • steroid hormone mediated signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic hindlimb morphogenesis • retinoic acid receptor signaling pathway • negative regulation of cell population proliferation • embryonic eye morphogenesis • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of programmed cell death • cellular response to leukemia inhibitory factor • multicellular organism development • hormone-mediated signaling pathway • диференціація клітин • response to lipid Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5916	19411
Ensembl	ENSG00000172819	ENSMUSG00000001288
UniProt	P13631	P18911
RefSeq (мРНК)	NM_000966 NM_001042728 NM_001243730 NM_001243731 NM_001243732	NM_001042727 NM_011244
RefSeq (білок)	NP_000957 NP_001036193 NP_001230659 NP_001230660 NP_001230661	NP_001036192 NP_035374
Локус (UCSC)	Хр. 12: 53.21 – 53.23 Mb	Хр. 15: 102.14 – 102.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RARG (англ. Retinoic acid receptor gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 454 амінокислот, а молекулярна маса — 50 342.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATNKERLFA		AGALGPGSGY		PGAGFPFAFP		GALRGSPPFE		MLSPSFRGLG
QPDLPKEMAS		LSVETQSTSS		EEMVPSSPSP		PPPPRVYKPC		FVCNDKSSGY
HYGVSSCEGC		KGFFRRSIQK		NMVYTCHRDK		NCIINKVTRN		RCQYCRLQKC
FEVGMSKEAV		RNDRNKKKKE		VKEEGSPDSY		ELSPQLEELI		TKVSKAHQET
FPSLCQLGKY		TTNSSADHRV		QLDLGLWDKF		SELATKCIIK		IVEFAKRLPG
FTGLSIADQI		TLLKAACLDI		LMLRICTRYT		PEQDTMTFSD		GLTLNRTQMH
NAGFGPLTDL		VFAFAGQLLP		LEMDDTETGL		LSAICLICGD		RMDLEEPEKV
DKLQEPLLEA		LRLYARRRRP		SQPYMFPRML		MKITDLRGIS		TKGAERAITL
KMEIPGPMPP		LIREMLENPE		MFEDDSSQPG		PHPNASSEDE		VPGGQGKGGL
KSPA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Krust A., Kastner P., Petkovich M., Zelent A., Chambon P. (1989). A third human retinoic acid receptor, hRAR-gamma. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 5310—5314. PMID 2546152 DOI:10.1073/pnas.86.14.5310
• Lehmann J.M., Hoffmann B., Pfahl M. (1991). Genomic organization of the retinoic acid receptor gamma gene. Nucleic Acids Res. 19: 573—578. PMID 1849262 DOI:10.1093/nar/19.3.573
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lehmann J.M., Zhang X.K., Pfahl M. (1992). RAR-gamma-2 expression is regulated through a retinoic acid response element embedded in Sp1 sites. Mol. Cell. Biol. 12: 2976—2985. PMID 1320193 DOI:10.1128/MCB.12.7.2976

Див. також

• Хромосома 12