Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
GLIS1
Ідентифікатори
Символи
GLIS1 , GLIS family zinc finger 1
Зовнішні ІД
OMIM : 610378 MGI: 2386723 HomoloGene: 77390 GeneCards: GLIS1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • osteoblast differentiation • negative regulation of cell fate commitment • fat cell differentiation • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 53.51 – 53.74 Mb
Хр. 4: 107.29 – 107.49 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
GLIS1 (англ. GLIS family zinc finger 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 620 амінокислот , а молекулярна маса — 65 976[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAEARTSLSA HCRGPLATGL HPDLDLPGRS LATPAPSCYL LGSEPSSGLG
LQPETHLPEG SLKRCCVLGL PPTSPASSSP CASSDVTSII RSSQTSLVTC
VNGLRSPPLT GDLGGPSKRA RPGPASTDSH EGSLQLEACR KASFLKQEPA
DEFSELFGPH QQGLPPPYPL SQLPPGPSLG GLGLGLAGRV VAGRQACRWV
DCCAAYEQQE ELVRHIEKSH IDQRKGEDFT CFWAGCVRRY KPFNARYKLL
IHMRVHSGEK PNKCMFEGCS KAFSRLENLK IHLRSHTGEK PYLCQHPGCQ
KAFSNSSDRA KHQRTHLDTK PYACQIPGCS KRYTDPSSLR KHVKAHSAKE
QQVRKKLHAG PDTEADVLTE CLVLQQLHTS TQLAASDGKG GCGLGQELLP
GVYPGSITPH NGLASGLLPP AHDVPSRHHP LDATTSSHHH LSPLPMAEST
RDGLGPGLLS PIVSPLKGLG PPPLPPSSQS HSPGGQPFPT LPSKPSYPPF
QSPPPPPLPS PQGYQGSFHS IQSCFPYGDC YRMAEPAAGG DGLVGETHGF
NPLRPNGYHS LSTPLPATGY EALAEASCPT ALPQQPSEDV VSSGPEDCGF
FPNGAFDHCL GHIPSIYTDT
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші