RFX1

RFX1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1DP7
Ідентифікатори
Символи	RFX1, EFC, RFX, regulatory factor X1
Зовнішні ІД	OMIM: 600006 MGI: 105982 HomoloGene: 2189 GeneCards: RFX1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity;
Клітинна компонента	• внутрішньоклітинна мембранна органела; • нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • transcription, DNA-templated; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5989
	19724
	ENSG00000132005; ENSG00000288283
	ENSMUSG00000031706
	P22670
	P48377
	NM_002918
	NM_009055
	NP_002909
	NP_033081
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RFX1 (англ. Regulatory factor X1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 979 амінокислот, а молекулярна маса — 104 758^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATQAYTELQ	AAPPPSQPPQ	APPQAQPQPP	PPPPPAAPQP	PQPPTAAATP
QPQYVTELQS	PQPQAQPPGG	QKQYVTELPA	VPAPSQPTGA	PTPSPAPQQY
IVVTVSEGAM	RASETVSEAS	PGSTASQTGV	PTQVVQQVQG	TQQRLLVQTS
VQAKPGHVSP	LQLTNIQVPQ	QALPTQRLVV	QSAAPGSKGG	QVSLTVHGTQ
QVHSPPEQSP	VQANSSSSKT	AGAPTGTVPQ	QLQVHGVQQS	VPVTQERSVV
QATPQAPKPG	PVQPLTVQGL	QPVHVAQEVQ	QLQQVPVPHV	YSSQVQYVEG
GDASYTASAI	RSSTYSYPET	PLYTQTASTS	YYEAAGTATQ	VSTPATSQAV
ASSGSMPMYV	SGSQVVASST	STGAGASNSS	GGGGSGGGGG	GGGGGGGGGS
GSTGGGGSGA	GTYVIQGGYM	LGSASQSYSH	TTRASPATVQ	WLLDNYETAE
GVSLPRSTLY	CHYLLHCQEQ	KLEPVNAASF	GKLIRSVFMG	LRTRRLGTRG
NSKYHYYGLR	IKASSPLLRL	MEDQQHMAMR	GQPFSQKQRL	KPIQKMEGMT
NGVAVGQQPS	TGLSDISAQV	QQYQQFLDAS	RSLPDFTELD	LQGKVLPEGV
GPGDIKAFQV	LYREHCEAIV	DVMVNLQFTL	VETLWKTFWR	YNLSQPSEAP
PLAVHDEAEK	RLPKAILVLL	SKFEPVLQWT	KHCDNVLYQG	LVEILIPDVL
RPIPSALTQA	IRNFAKSLES	WLTHAMVNIP	EEMLRVKVAA	AGAFAQTLRR
YTSLNHLAQA	ARAVLQNTAQ	INQMLSDLNR	VDFANVQEQA	SWVCRCEDRV
VQRLEQDFKV	TLQQQNSLEQ	WAAWLDGVVS	QVLKPYQGSA	GFPKAAKLFL
LKWSFYSSMV	IRDLTLRSAA	SFGSFHLIRL	LYDEYMYYLI	EHRVAQAKGE
TPIAVMGEFA	NLATSLNPLD	PDKDEEEEEE	EESEDELPQD	ISLAAGGESP
ALGPETLEPP	AKLARTDARG	LFVQALPSS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Safrany G., Perry R.P. (1993). Transcription factor RFX1 helps control the promoter of the mouse ribosomal protein-encoding gene rpL30 by binding to its alpha element. Gene. 132: 279—283. PMID 8224874 DOI:10.1016/0378-1119(93)90208-K
Sanchez-Herrero C., Reith W., Silacci P., Mach B. (1992). The DNA-binding defect observed in major histocompatibility complex class II regulatory mutants concerns only one member of a family of complexes binding to the X boxes of class II promoters. Mol. Cell. Biol. 12: 4076—4083. PMID 1508204

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9982 (англ.) . Архів оригіналу за 19 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-19 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P22670 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9982 (англ.) . Архів оригіналу за 19 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-19 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P22670 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]