NFIA

NFIA
Ідентифікатори
Символи	NFIA, CTF, NF-I/A, NF1-A, NFI-A, NFI-L, nuclear factor I A, BRMUTD
Зовнішні ІД	OMIM: 600727 MGI: 108056 HomoloGene: 4086 GeneCards: NFIA
Пов'язані генетичні захворювання
целіакія, chromosome 1p32-p31 deletion syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • міжклітинні контакти • внутрішньоклітинний • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • viral genome replication • реплікація ДНК • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • synapse maturation • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ureter development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4774	18027
Ensembl	ENSG00000162599	ENSMUSG00000028565
UniProt	Q12857	Q02780
RefSeq (мРНК)	NM_001134673 NM_001145511 NM_001145512 NM_005595	NM_001122952 NM_001122953 NM_010905
RefSeq (білок)	NP_001128145 NP_001138983 NP_001138984 NP_005586	NP_001116424 NP_001116425 NP_035035
Локус (UCSC)	Хр. 1: 60.87 – 61.46 Mb	Хр. 4: 97.66 – 98.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NFIA (англ. Nuclear factor I A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 55 944.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYSPLCLTQD		EFHPFIEALL		PHVRAFAYTW		FNLQARKRKY		FKKHEKRMSK
EEERAVKDEL		LSEKPEVKQK		WASRLLAKLR		KDIRPEYRED		FVLTVTGKKP
PCCVLSNPDQ		KGKMRRIDCL		RQADKVWRLD		LVMVILFKGI		PLESTDGERL
VKSPQCSNPG		LCVQPHHIGV		SVKELDLYLA		YFVHAADSSQ		SESPSQPSDA
DIKDQPENGH		LGFQDSFVTS		GVFSVTELVR		VSQTPIAAGT		GPNFSLSDLE
SSSYYSMSPG		AMRRSLPSTS		STSSTKRLKS		VEDEMDSPGE		EPFYTGQGRS
PGSGSQSSGW		HEVEPGMPSP		TTLKKSEKSG		FSSPSPSQTS		SLGTAFTQHH
RPVITGPRAS		PHATPSTLHF		PTSPIIQQPG		PYFSHPAIRY		HPQETLKEFV
QLVCPDAGQQ		AGQVGFLNPN		GSSQGKVHNP		FLPTPMLPPP		PPPPMARPVP
LPVPDTKPPT		TSTEGGAASP		TSPTYSTPST		SPANRFVSVG		PRDPSFVNIP
QQTQSWYLG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, реплікація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Qian F., Kruse U., Lichter P., Sippel A.E. (1995). Chromosomal localization of the four genes (NFIA, B, C, and X) for the human transcription factor nuclear factor I by FISH. Genomics. 28: 66—73. PMID 7590749 DOI:10.1006/geno.1995.1107

Див. також

• Хромосома 1