Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ZNF35
Ідентифікатори
Символи
ZNF35 , HF.10, HF10, Zfp105, zinc finger protein 35
Зовнішні ІД
OMIM : 194533 MGI: 1277119 HomoloGene: 2568 GeneCards: ZNF35
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро
Біологічний процес
• cellular response to retinoic acid • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • Сперматогенез • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 3: 44.65 – 44.66 Mb
Хр. 9: 122.75 – 122.76 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ZNF35 (англ. Zinc finger protein 35 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 527 амінокислот , а молекулярна маса — 59 089[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MTAELREAMA LAPWGPVKVK KEEEEEENFP GQASSQQVHS ENIKVWAPVQ
GLQTGLDGSE EEEKGQNISW DMAVVLKATQ EAPAASTLGS YSLPGTLAKS
EILETHGTMN FLGAETKNLQ LLVPKTEICE EAEKPLIISE RIQKADPQGP
ELGEACEKGN MLKRQRIKRE KKDFRQVIVN DCHLPESFKE EENQKCKKSG
GKYSLNSGAV KNPKTQLGQK PFTCSVCGKG FSQSANLVVH QRIHTGEKPF
ECHECGKAFI QSANLVVHQR IHTGQKPYVC SKCGKAFTQS SNLTVHQKIH
SLEKTFKCNE CEKAFSYSSQ LARHQKVHIT EKCYECNECG KTFTRSSNLI
VHQRIHTGEK PFACNDCGKA FTQSANLIVH QRSHTGEKPY ECKECGKAFS
CFSHLIVHQR IHTAEKPYDC SECGKAFSQL SCLIVHQRIH SGDLPYVCNE
CGKAFTCSSY LLIHQRIHNG EKPYTCNECG KAFRQRSSLT VHQRTHTGEK
PYECEKCGAA FISNSHLMRH HRTHLVE
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші