Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TBPL1
Ідентифікатори
Символи
TBPL1 , MGC:8389, MGC:9620, STUD, TLF, TLP, TRF2, TATA-box binding protein like 1
Зовнішні ІД
OMIM : 605521 MGI: 1339946 HomoloGene: 3577 GeneCards: TBPL1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • RNA polymerase III transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding
Клітинна компонента
• цитоплазма • transcription factor TFIIA complex • клітинне ядро • transcription factor TFIIIB complex • transcription regulator complex • transcription factor TFIID complex
Біологічний процес
• spermatid nucleus differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • acrosome assembly • dTTP biosynthetic process • transcription, DNA-templated • Сперматогенез • DNA-templated transcription, initiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • RNA polymerase III preinitiation complex assembly
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 6: 133.95 – 133.99 Mb
Хр. 10: 22.58 – 22.61 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
TBPL1 (англ. TATA-box binding protein like 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 186 амінокислот , а молекулярна маса — 20 887[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDADSDVALD ILITNVVCVF RTRCHLNLRK IALEGANVIY KRDVGKVLMK
LRKPRITATI WSSGKIICTG ATSEEEAKFG ARRLARSLQK LGFQVIFTDF
KVVNVLAVCN MPFEIRLPEF TKNNRPHASY EPELHPAVCY RIKSLRATLQ
IFSTGSITVT GPNVKAVATA VEQIYPFVFE SRKEIL
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Rabenstein M.D., Zhou S., Lis J.T., Tjian R. (1999). TATA box-binding protein (TBP)-related factor 2 (TRF2), a third member of the TBP family. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 96 : 4791—4796. PMID 10220372 doi :10.1073/pnas.96.9.4791
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші