Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TOX3
Ідентифікатори
Символи
TOX3 , CAGF9, TNRC9, TOX high mobility group box family member 3
Зовнішні ІД
OMIM : 611416 MGI: 3039593 HomoloGene: 18257 GeneCards: TOX3
Пов'язані генетичні захворювання
рак молочної залози [1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • estrogen response element binding • phosphoprotein binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0097285 апоптоз • regulation of apoptotic process • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 16: 52.44 – 52.55 Mb
Хр. 8: 90.97 – 91.07 Mb
PubMed search
[2]
[3] Вікідані
TOX3 (англ. TOX high mobility group box family member 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 576 амінокислот , а молекулярна маса — 63 342[5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDVRFYPAAA GDPASLDFAQ CLGYYGYSKF GNNNNYMNMA EANNAFFAAS
EQTFHTPSLG DEEFEIPPIT PPPESDPALG MPDVLLPFQA LSDPLPSQGS
EFTPQFPPQS LDLPSITISR NLVEQDGVLH SSGLHMDQSH TQVSQYRQDP
SLIMRSIVHM TDAARSGVMP PAQLTTINQS QLSAQLGLNL GGASMPHTSP
SPPASKSATP SPSSSINEED ADEANRAIGE KRAAPDSGKK PKTPKKKKKK
DPNEPQKPVS AYALFFRDTQ AAIKGQNPNA TFGEVSKIVA SMWDSLGEEQ
KQVYKRKTEA AKKEYLKALA AYRASLVSKA AAESAEAQTI RSVQQTLAST
NLTSSLLLNT PLSQHGTVSA SPQTLQQSLP RSIAPKPLTM RLPMNQIVTS
VTIAANMPSN IGAPLISSMG TTMVGSAPST QVSPSVQTQQ HQMQLQQQQQ
QQQQQMQQMQ QQQLQQHQMH QQIQQQMQQQ HFQHHMQQHL QQQQQHLQQQ
INQQQLQQQL QQRLQLQQLQ HMQHQSQPSP RQHSPVASQI TSPIPAIGSP
QPASQQHQSQ IQSQTQTQVL SQVSIF
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз , транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші