CTCF

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
CTCF
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CTCF, MRD21, CCCTC-binding factor, FAP108, CFAP108
Зовнішні ІД OMIM: 604167 MGI: 109447 HomoloGene: 4786 GeneCards: CTCF
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 21, syndromic intellectual disability[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001191022
NM_006565
NM_001363916
NM_181322
NM_001358924
RefSeq (білок)
NP_001177951
NP_006556
NP_001350845
Локус (UCSC) Хр. 16: 67.56 – 67.64 Mb Хр. 8: 105.64 – 105.68 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CTCF (англ. CCCTC-binding factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 727 амінокислот, а молекулярна маса — 82 785[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEGDAVEAIVEESETFIKGKERKTYQRRREGGQEEDACHLPQNQTDGGEV
VQDVNSSVQMVMMEQLDPTLLQMKTEVMEGTVAPEAEAAVDDTQIITLQV
VNMEEQPINIGELQLVQVPVPVTVPVATTSVEELQGAYENEVSKEGLAES
EPMICHTLPLPEGFQVVKVGANGEVETLEQGELPPQEDPSWQKDPDYQPP
AKKTKKTKKSKLRYTEEGKDVDVSVYDFEEEQQEGLLSEVNAEKVVGNMK
PPKPTKIKKKGVKKTFQCELCSYTCPRRSNLDRHMKSHTDERPHKCHLCG
RAFRTVTLLRNHLNTHTGTRPHKCPDCDMAFVTSGELVRHRRYKHTHEKP
FKCSMCDYASVEVSKLKRHIRSHTGERPFQCSLCSYASRDTYKLKRHMRT
HSGEKPYECYICHARFTQSGTMKMHILQKHTENVAKFHCPHCDTVIARKS
DLGVHLRKQHSYIEQGKKCRYCDAVFHERYALIQHQKSHKNEKRFKCDQC
DYACRQERHMIMHKRTHTGEKPYACSHCDKTFRQKQLLDMHFKRYHDPNF
VPAAFVCSKCGKTFTRRNTMARHADNCAGPDGVEGENGGETKKSKRGRKR
KMRSKKEDSSDSENAEPDLDDNEDEEEPAVEIEPEPEPQPVTPAPPPAKK
RRGRPPGRTNQPKQNQPTAIIQVEDQNTGAIENIIVEVKKEPDAEPAEGE
EEEAQPAATDAPNGDLTPEMILSMMDR

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, розходження хромосом, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах, центромерах.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Vostrov A.A., Quitschke W.W. (1997). The zinc finger protein CTCF binds to the APBbeta domain of the amyloid beta-protein precursor promoter. Evidence for a role in transcriptional activation. J. Biol. Chem. 272: 33353—33359. PMID 9407128 DOI:10.1074/jbc.272.52.33353
  • Klenova E.M., Morse H.C. III, Ohlsson R., Lobanenkov V.V. (2002). The novel BORIS + CTCF gene family is uniquely involved in the epigenetics of normal biology and cancer. Semin. Cancer Biol. 12: 399—414. PMID 12191639 DOI:10.1016/S1044-579X(02)00060-3
  • Chao W., Huynh K.D., Spencer R.J., Davidow L.S., Lee J.T. (2002). CTCF, a candidate trans-acting factor for X-inactivation choice. Science. 295: 345—347. PMID 11743158 DOI:10.1126/science.1065982
  • Ishihara K., Oshimura M., Nakao M. (2006). CTCF-dependent chromatin insulator is linked to epigenetic remodeling. Mol. Cell. 23: 733—742. PMID 16949368 DOI:10.1016/j.molcel.2006.08.008
  • Majumder P., Gomez J.A., Chadwick B.P., Boss J.M. (2008). The insulator factor CTCF controls MHC class II gene expression and is required for the formation of long-distance chromatin interactions. J. Exp. Med. 205: 785—798. PMID 18347100 DOI:10.1084/jem.20071843

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з CTCF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13723 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2018. Процитовано 11 вересня 2017.
  5. UniProt, P49711 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]