Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TOX2
Ідентифікатори
Символи
TOX2 , C20orf100, GCX-1, GCX1, dJ1108D11.2, dJ495O3.1, TOX high mobility group box family member 2
Зовнішні ІД
OMIM : 611163 MGI: 3611233 HomoloGene: 13155 GeneCards: TOX2
Пов'язані генетичні захворювання
conduct disorder [1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 20: 43.91 – 44.07 Mb
Хр. 2: 163.05 – 163.17 Mb
PubMed search
[2]
[3] Вікідані
TOX2 (англ. TOX high mobility group box family member 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 488 амінокислот , а молекулярна маса — 51 604[5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MQQTRTEAVA GAFSRCLGFC GMRLGLLLLA RHWCIAGVFP QKFDGDSAYV
GMSDGNPELL STSQTYNGQS ENNEDYEIPP ITPPNLPEPS LLHLGDHEAS
YHSLCHGLTP NGLLPAYSYQ AMDLPAIMVS NMLAQDSHLL SGQLPTIQEM
VHSEVAAYDS GRPGPLLGRP AMLASHMSAL SQSQLISQMG IRSSIAHSSP
SPPGSKSATP SPSSSTQEEE SEVHFKISGE KRPSADPGKK AKNPKKKKKK
DPNEPQKPVS AYALFFRDTQ AAIKGQNPSA TFGDVSKIVA SMWDSLGEEQ
KQSSPDQGET KSTQANPPAK MLPPKQPMYA MPGLASFLTP SDLQAFRSGA
SPASLARTLG SKSLLPGLSA SPPPPPSFPL SPTLHQQLSL PPHAQGALLS
PPVSMSPAPQ PPVLPTPMAL QVQLAMSPSP PGPQDFPHIS EFPSSSGSCS
PGPSNPTSSG DWDSSYPSGE CGISTCSLLP RDKSLYLT
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші