Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
POU3F1
Ідентифікатори
Символи
POU3F1 , OCT6, OTF6, SCIP, POU class 3 homeobox 1
Зовнішні ІД
OMIM : 602479 HomoloGene: 135923 GeneCards: POU3F1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• transcription regulator complex • клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• axon ensheathment • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • myelination • forebrain development • Schwann cell development • brain development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • myelination in peripheral nervous system • keratinocyte differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • epidermis development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901313 positive regulation of gene expression • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 38.04 – 38.05 Mb
н/д
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
POU3F1 (англ. POU class 3 homeobox 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 451 амінокислот , а молекулярна маса — 45 496[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MATTAQYLPR GPGGGAGGTG PLMHPDAAAA AAAAAAAERL HAGAAYREVQ
KLMHHEWLGA GAGHPVGLAH PQWLPTGGGG GGDWAGGPHL EHGKAGGGGT
GRADDGGGGG GFHARLVHQG AAHAGAAWAQ GSTAHHLGPA MSPSPGASGG
HQPQPLGLYA QAAYPGGGGG GLAGMLAAGG GGAGPGLHHA LHEDGHEAQL
EPSPPPHLGA HGHAHGHAHA GGLHAAAAHL HPGAGGGGSS VGEHSDEDAP
SSDDLEQFAK QFKQRRIKLG FTQADVGLAL GTLYGNVFSQ TTICRFEALQ
LSFKNMCKLK PLLNKWLEET DSSSGSPTNL DKIAAQGRKR KKRTSIEVGV
KGALESHFLK CPKPSAHEIT GLADSLQLEK EVVRVWFCNR RQKEKRMTPA
AGAGHPPMDD VYAPGELGPG GGGASPPSAP PPPPPAALHH HHHHTLPGSV
Q
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші