Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
FOXA1
Ідентифікатори
Символи
FOXA1 , HNF3A, TCF3A, forkhead box A1
Зовнішні ІД
OMIM : 602294 MGI: 1347472 HomoloGene: 3307 GeneCards: FOXA1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • protein domain specific binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• Мікроворсинки • клітинне ядро • fibrillar center • нуклеоплазма
Біологічний процес
• Сигнальний шлях Notch • prostate gland stromal morphogenesis • dopaminergic neuron differentiation • positive regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway • response to estradiol • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • lung morphogenesis • glucose homeostasis • positive regulation of smoothened signaling pathway • lung development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • neuron fate specification • anatomical structure formation involved in morphogenesis • positive regulation of mitotic cell cycle • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • tube morphogenesis • secretory columnal luminar epithelial cell differentiation involved in prostate glandular acinus development • transcription, DNA-templated • regulation of cell cycle • multicellular organism development • prostate gland epithelium morphogenesis • connective tissue development • positive regulation of neuron differentiation • epithelial cell maturation involved in prostate gland development • регуляція експресії генів • lung epithelial cell differentiation • dorsal/ventral neural tube patterning • epithelial-mesenchymal signaling involved in prostate gland development • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis • respiratory basal cell differentiation • hormone metabolic process • alveolar secondary septum development • negative regulation of epithelial to mesenchymal transition • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by cadherin • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • ремоделювання хроматину • anatomical structure morphogenesis • positive regulation of apoptotic process • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 14: 37.59 – 37.6 Mb
Хр. 12: 57.59 – 57.59 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
FOXA1 (англ. Forkhead box A1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 472 амінокислот , а молекулярна маса — 49 148[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLGTVKMEGH ETSDWNSYYA DTQEAYSSVP VSNMNSGLGS MNSMNTYMTM
NTMTTSGNMT PASFNMSYAN PGLGAGLSPG AVAGMPGGSA GAMNSMTAAG
VTAMGTALSP SGMGAMGAQQ AASMNGLGPY AAAMNPCMSP MAYAPSNLGR
SRAGGGGDAK TFKRSYPHAK PPYSYISLIT MAIQQAPSKM LTLSEIYQWI
MDLFPYYRQN QQRWQNSIRH SLSFNDCFVK VARSPDKPGK GSYWTLHPDS
GNMFENGCYL RRQKRFKCEK QPGAGGGGGS GSGGSGAKGG PESRKDPSGA
SNPSADSPLH RGVHGKTGQL EGAPAPGPAA SPQTLDHSGA TATGGASELK
TPASSTAPPI SSGPGALASV PASHPAHGLA PHESQLHLKG DPHYSFNHPF
SINNLMSSSE QQHKLDFKAY EQALQYSPYG STLPASLPLG SASVTTRSPI
EPSALEPAYY QGVYSRPVLN TS
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , регуляторів хроматину , білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші