Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
ETV2
Ідентифікатори
Символи
ETV2 , ER71, ETSRP71, Ets variant 2, ETS variant transcription factor 2
Зовнішні ІД
OMIM : 609358 MGI: 99253 HomoloGene: 7308 GeneCards: ETV2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• Сигнальний шлях Notch • диференціація клітин • positive regulation of endothelial cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • blood vessel morphogenesis • placenta development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • mesoderm formation • in utero embryonic development • Wnt signaling pathway • transcription by RNA polymerase II • positive regulation of mesoderm development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • BMP signaling pathway involved in mesodermal cell fate specification • erythrocyte differentiation • blastocyst development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • кровотворення
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 35.64 – 35.64 Mb
Хр. 7: 30.33 – 30.34 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
ETV2 (англ. ETS variant 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 342 амінокислот , а молекулярна маса — 36 633[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MDLWNWDEAS PQEVPPGNKL AGLEGAKLGF CFPDLALQGD TPTATAETCW
KGTSSSLASF PQLDWGSALL HPEVPWGAEP DSQALPWSGD WTDMACTAWD
SWSGASQTLG PAPLGPGPIP AAGSEGAAGQ NCVPVAGEAT SWSRAQAAGS
NTSWDCSVGP DGDTYWGSGL GGEPRTDCTI SWGGPAGPDC TTSWNPGLHA
GGTTSLKRYQ SSALTVCSEP SPQSDRASLA RCPKTNHRGP IQLWQFLLEL
LHDGARSSCI RWTGNSREFQ LCDPKEVARL WGERKRKPGM NYEKLSRGLR
YYYRRDIVRK SGGRKYTYRF GGRVPSLAYP DCAGGGRGAE TQ
Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші