Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXB3
Ідентифікатори
Символи
HOXB3 , HOX2, HOX2G, Hox-2.7, homeobox B3
Зовнішні ІД
OMIM : 142966 MGI: 96184 HomoloGene: 1617 GeneCards: HOXB3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• embryonic skeletal system morphogenesis • multicellular organism development • glossopharyngeal nerve morphogenesis • definitive hemopoiesis • thyroid gland development • cartilage development • face development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of neurogenesis • rhombomere development • Ангіогенез • hematopoietic progenitor cell differentiation • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 48.55 – 48.6 Mb
Хр. 11: 96.21 – 96.24 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HOXB3 (англ. Homeobox B3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 431 амінокислот , а молекулярна маса — 44 340[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MQKATYYDNA AAALFGGYSS YPGSNGFGFD VPPQPPFQAA THLEGDYQRS
ACSLQSLGNA APHAKSKELN GSCMRPGLAP EPLSAPPGSP PPSAAPTSAT
SNSSNGGGPS KSGPPKCGPG TNSTLTKQIF PWMKESRQTS KLKNNSPGTA
EGCGGGGGGG GGGGSGGSGG GGGGGGGGDK SPPGSAASKR ARTAYTSAQL
VELEKEFHFN RYLCRPRRVE MANLLNLSER QIKIWFQNRR MKYKKDQKAK
GLASSSGGPS PAGSPPQPMQ STAGFMNALH SMTPSYESPS PPAFGKAHQN
AYALPSNYQP PLKGCGAPQK YPPTPAPEYE PHVLQANGGA YGTPTMQGSP
VYVGGGGYAD PLPPPAGPSL YGLNHLSHHP SGNLDYNGAP PMAPSQHHGP
CEPHPTYTDL SSHHAPPPQG RIQEAPKLTH L
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші