TFAP2C

TFAP2C
Ідентифікатори
Символи	TFAP2C, AP2-GAMMA, ERF1, TFAP2G, hAP-2g, transcription factor AP-2 gamma
Зовнішні ІД	OMIM: 601602 MGI: 106032 HomoloGene: 2423 GeneCards: TFAP2C
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein dimerization activity • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • мітохондрія • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cell-cell signaling • male gonad development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cell population proliferation • Епігенетичне успадкування • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7022	21420
Ensembl	ENSG00000087510	ENSMUSG00000028640
UniProt	Q92754	Q61312
RefSeq (мРНК)	NM_003222	NM_001159696 NM_009335
RefSeq (білок)	NP_003213	NP_001153168 NP_033361
Локус (UCSC)	Хр. 20: 56.63 – 56.64 Mb	Хр. 2: 172.39 – 172.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TFAP2C (англ. Transcription factor AP-2 gamma) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 49 177.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLWKITDNVK		YEEDCEDRHD		GSSNGNPRVP		HLSSAGQHLY		SPAPPLSHTG
VAEYQPPPYF		PPPYQQLAYS		QSADPYSHLG		EAYAAAINPL		HQPAPTGSQQ
QAWPGRQSQE		GAGLPSHHGR		PAGLLPHLSG		LEAGAVSARR		DAYRRSDLLL
PHAHALDAAG		LAENLGLHDM		PHQMDEVQNV		DDQHLLLHDQ		TVIRKGPISM
TKNPLNLPCQ		KELVGAVMNP		TEVFCSVPGR		LSLLSSTSKY		KVTVAEVQRR
LSPPECLNAS		LLGGVLRRAK		SKNGGRSLRE		KLDKIGLNLP		AGRRKAAHVT
LLTSLVEGEA		VHLARDFAYV		CEAEFPSKPV		AEYLTRPHLG		GRNEMAARKN
MLLAAQQLCK		EFTELLSQDR		TPHGTSRLAP		VLETNIQNCL		SHFSLITHGF
GSQAICAAVS		ALQNYIKEAL		IVIDKSYMNP		GDQSPADSNK		TLEKMEKHRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• McPherson L.A., Baichwal V.R., Weigel R.J. (1997). Identification of ERF-1 as a member of the AP2 transcription factor family. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 4342—4347. PMID 9113991 DOI:10.1073/pnas.94.9.4342
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Eloranta J.J., Hurst H.C. (2002). Transcription factor AP-2 interacts with the SUMO-conjugating enzyme UBC9 and is sumolated in vivo. J. Biol. Chem. 277: 30798—30804. PMID 12072434 DOI:10.1074/jbc.M202780200

Див. також

• Хромосома 20