Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXB9
Ідентифікатори
Символи
HOXB9 , HOX-2.5, HOX2, HOX2E, homeobox B9
Зовнішні ІД
OMIM : 142964 MGI: 96190 HomoloGene: 7367 GeneCards: HOXB9
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • мітохондрія • нуклеоплазма • RNA polymerase II transcription regulator complex
Біологічний процес
• cell chemotaxis • canonical Wnt signaling pathway • multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic skeletal system development • mammary gland development
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 48.62 – 48.63 Mb
Хр. 11: 96.16 – 96.17 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HOXB9 (англ. Homeobox B9 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 250 амінокислот , а молекулярна маса — 28 059[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSISGTLSSY YVDSIISHES EDAPPAKFPS GQYASSRQPG HAEHLEFPSC
SFQPKAPVFG ASWAPLSPHA SGSLPSVYHP YIQPQGVPPA ESRYLRTWLE
PAPRGEAAPG QGQAAVKAEP LLGAPGELLK QGTPEYSLET SAGREAVLSN
QRPGYGDNKI CEGSEDKERP DQTNPSANWL HARSSRKKRC PYTKYQTLEL
EKEFLFNMYL TRDRRHEVAR LLNLSERQVK IWFQNRRMKM KKMNKEQGKE
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші