HOXB1

HOXB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1B72
Ідентифікатори
Символи	HOXB1, HCFP3, HOX2, HOX2I, Hox-2.9, homeobox B1
Зовнішні ІД	OMIM: 142968 MGI: 96182 HomoloGene: 1615 GeneCards: HOXB1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • protein domain specific binding; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро;
Біологічний процес	• multicellular organism development; • pattern specification process; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • anatomical structure morphogenesis; • anterior/posterior pattern specification; • rhombomere development; • rhombomere 4 development; • rhombomere 5 development; • facial nerve structural organization; • facial nucleus development; • anatomical structure formation involved in morphogenesis; • embryonic skeletal system morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3211
	15407
	ENSG00000120094
	ENSMUSG00000018973
	P14653
	P17919
	NM_002144
	NM_008266
	NP_002135
	NP_032292
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

HOXB1 (англ. Homeobox B1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 301 амінокислот, а молекулярна маса — 32 193^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M D Y N R M N S F L	E Y P L C N R G P S	A Y S A H S A P T S	F P P S S A Q A V D	S Y A S E G R Y G G
G L S S P A F Q Q N	S G Y P A Q Q P P S	T L G V P F P S S A	P S G Y A P A A C S	P S Y G P S Q Y Y P
L G Q S E G D G G Y	F H P S S Y G A Q L	G G L S D G Y G A G	G A G P G P Y P P Q	H P P Y G N E Q T A
S F A P A Y A D L L	S E D K E T P C P S	E P N T P T A R T F	D W M K V K R N P P	K T A K V S E P G L
G S P S G L R T N F	T T R Q L T E L E K	E F H F N K Y L S R	A R R V E I A A T L	E L N E T Q V K I W
F Q N R R M K Q K K	R E R E E G R V P P	A P P G C P K E A A	G D A S D Q S T C T	S P E A S P S S V T
S

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Piper D.E., Batchelor A.H., Chang C.-P., Cleary M.L., Wolberger C. (1999). Structure of a HoxB1-Pbx1 heterodimer bound to DNA: role of the hexapeptide and a fourth homeodomain helix in complex formation. Cell. 96: 587—597. PMID 10052460 DOI:10.1016/s0092-8674(00)80662-5

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5111 (англ.) . Архів оригіналу за 8 липня 2017. Процитовано 10 березня 2020.
↑ UniProt, P14653 (англ.) . Архів оригіналу за 30 липня 2020. Процитовано 10 березня 2020.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5111 (англ.) . Архів оригіналу за 8 липня 2017. Процитовано 10 березня 2020.

[UniProt-4] UniProt, P14653 (англ.) . Архів оригіналу за 30 липня 2020. Процитовано 10 березня 2020.

[1]

[2]

[3]

[4]

HOXB1

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук