ZBTB16

ZBTB16
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BUO, 1CS3
Ідентифікатори
Символи	ZBTB16, PLZF, ZNF145, zinc finger and BTB domain containing 16
Зовнішні ІД	OMIM: 176797 MGI: 103222 HomoloGene: 21214 GeneCards: ZBTB16
Пов'язані генетичні захворювання
conduct disorder
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • nucleic acid binding • double-stranded DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • protein C-terminus binding • protein domain specific binding • sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • PML body • nuclear speck • ядерні тільця • клітинна мембрана • transcription repressor complex • клітинне ядро • гіалоплазма • GO:0009327 protein-containing complex • нуклеоплазма Біологічний процес • embryonic hindlimb morphogenesis • forelimb morphogenesis • skeletal system development • myeloid cell differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • embryonic pattern specification • embryonic digit morphogenesis • positive regulation of ossification • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • hindlimb morphogenesis • transcription, DNA-templated • mesonephros development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • central nervous system development • cartilage development • male germ-line stem cell asymmetric division • positive regulation of cartilage development • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of chondrocyte differentiation • positive regulation of apoptotic process • protein localization to nucleus • positive regulation of NK T cell differentiation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of fat cell differentiation • negative regulation of myeloid cell differentiation • anterior/posterior pattern specification • negative regulation of cell population proliferation • GO:0097285 апоптоз • посттрансляційна модифікація • кровотворення • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7704	235320
Ensembl	ENSG00000109906	ENSMUSG00000066687
UniProt	Q05516	Q3UQ17
RefSeq (мРНК)	NM_001018011 NM_006006 NM_001354750 NM_001354751 NM_001354752	NM_001033324 NM_001364543
RefSeq (білок)	NP_001018011 NP_005997 NP_001341679 NP_001341680 NP_001341681	NP_001028496 NP_001351472
Локус (UCSC)	Хр. 11: 114.06 – 114.26 Mb	Хр. 9: 48.57 – 48.75 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZBTB16 (англ. Zinc finger and BTB domain containing 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 673 амінокислот, а молекулярна маса — 74 274.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLTKMGMIQ		LQNPSHPTGL		LCKANQMRLA		GTLCDVVIMV		DSQEFHAHRT
VLACTSKMFE		ILFHRNSQHY		TLDFLSPKTF		QQILEYAYTA		TLQAKAEDLD
DLLYAAEILE		IEYLEEQCLK		MLETIQASDD		NDTEATMADG		GAEEEEDRKA
RYLKNIFISK		HSSEESGYAS		VAGQSLPGPM		VDQSPSVSTS		FGLSAMSPTK
AAVDSLMTIG		QSLLQGTLQP		PAGPEEPTLA		GGGRHPGVAE		VKTEMMQVDE
VPSQDSPGAA		ESSISGGMGD		KVEERGKEGP		GTPTRSSVIT		SARELHYGRE
ESAEQVPPPA		EAGQAPTGRP		EHPAPPPEKH		LGIYSVLPNH		KADAVLSMPS
SVTSGLHVQP		ALAVSMDFST		YGGLLPQGFI		QRELFSKLGE		LAVGMKSESR
TIGEQCSVCG		VELPDNEAVE		QHRKLHSGMK		TYGCELCGKR		FLDSLRLRMH
LLAHSAGAKA		FVCDQCGAQF		SKEDALETHR		QTHTGTDMAV		FCLLCGKRFQ
AQSALQQHME		VHAGVRSYIC		SECNRTFPSH		TALKRHLRSH		TGDHPYECEF
CGSCFRDEST		LKSHKRIHTG		EKPYECNGCG		KKFSLKHQLE		THYRVHTGEK
PFECKLCHQR		SRDYSAMIKH		LRTHNGASPY		QCTICTEYCP		SLSSMQKHMK
GHKPEEIPPD		WRIEKTYLYL		CYV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Furukawa M., He Y.J., Borchers C., Xiong Y. (2003). Targeting of protein ubiquitination by BTB-Cullin 3-Roc1 ubiquitin ligases. Nat. Cell Biol. 5: 1001—1007. PMID 14528312 DOI:10.1038/ncb1056
• Ahmad K.F., Engel C.K., Prive G.G. (1998). Crystal structure of the BTB domain from PLZF. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 12123—12128. PMID 9770450 DOI:10.1073/pnas.95.21.12123

Див. також

• Хромосома 11