SOX14

SOX14
Ідентифікатори
Символи	SOX14, SOX28, SRY-box 14, SRY-box transcription factor 14
Зовнішні ІД	OMIM: 604747 MGI: 98362 HomoloGene: 31224 GeneCards: SOX14
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • компонент клітини Біологічний процес • regulation of neuron migration • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • зір • entrainment of circadian clock • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8403	20669
Ensembl	ENSG00000168875	ENSMUSG00000053747
UniProt	O95416	Q04892
RefSeq (мРНК)	NM_004189	NM_011440
RefSeq (білок)	NP_004180	NP_035570
Локус (UCSC)	Хр. 3: 137.76 – 137.77 Mb	Хр. 9: 99.76 – 99.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOX14 (англ. SRY-box 14) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 240 амінокислот, а молекулярна маса — 26 485.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSKPSDHIKR		PMNAFMVWSR		GQRRKMAQEN		PKMHNSEISK		RLGAEWKLLS
EAEKRPYIDE		AKRLRAQHMK		EHPDYKYRPR		RKPKNLLKKD		RYVFPLPYLG
DTDPLKAAGL		PVGASDGLLS		APEKARAFLP		PASAPYSLLD		PAQFSSSAIQ
KMGEVPHTLA		TGALPYASTL		GYQNGAFGSL		SCPSQHTHTH		PSPTNPGYVV
PCNCTAWSAS		TLQPPVAYIL		FPGMTKTGID		PYSSAHATAM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Malas S., Duthie S., Deloukas P., Episkopou V. (1999). The isolation and high-resolution chromosomal mapping of human SOX14 and SOX21; two members of the SOX gene family related to SOX1, SOX2, and SOX3. Mamm. Genome. 10: 934—937. PMID 10441749 DOI:10.1007/s003359901118
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Cremazy F., Soullier S., Berta P., Jay P. (1998). Further complexity of the human SOX gene family revealed by the combined use of highly degenerate primers and nested PCR. FEBS Lett. 438: 311—314. PMID 9827568 DOI:10.1016/S0014-5793(98)01294-0
• Arsic N., Rajic T., Stanojcic S., Goodfellow P.N., Stevanovic M. (1998). Characterisation and mapping of the human SOX14 gene. Cytogenet. Cell Genet. 83: 139—146. PMID 9925951

Див. також

• Хромосома 3