Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
DLX2
Ідентифікатори
Символи
DLX2 , TES-1, TES1, AW121999, Dlx-2, distal-less homeobox 2
Зовнішні ІД
OMIM : 126255 MGI: 94902 HomoloGene: 3244 GeneCards: DLX2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• cerebral cortex GABAergic interneuron differentiation • proximal/distal pattern formation • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • branching morphogenesis of a nerve • embryonic skeletal system development • multicellular organism development • odontogenesis of dentin-containing tooth • cerebral cortex GABAergic interneuron fate commitment • cartilage development • brain development • negative regulation of oligodendrocyte differentiation • forebrain neuron differentiation • embryonic cranial skeleton morphogenesis • olfactory bulb development • hippocampus development • subpallium development • negative regulation of Notch signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of cell differentiation • negative regulation of photoreceptor cell differentiation • positive regulation of amacrine cell differentiation • transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 172.1 – 172.1 Mb
Хр. 2: 71.37 – 71.38 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
DLX2 (англ. Distal-less homeobox 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 328 амінокислот , а молекулярна маса — 34 243[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MTGVFDSLVA DMHSTQIAAS STYHQHQQPP SGGGAGPGGN SSSSSSLHKP
QESPTLPVST ATDSSYYTNQ QHPAGGGGGG GSPYAHMGSY QYQASGLNNV
PYSAKSSYDL GYTAAYTSYA PYGTSSSPAN NEPEKEDLEP EIRIVNGKPK
KVRKPRTIYS SFQLAALQRR FQKTQYLALP ERAELAASLG LTQTQVKIWF
QNRRSKFKKM WKSGEIPSEQ HPGASASPPC ASPPVSAPAS WDFGVPQRMA
GGGGPGSGGS GAGSSGSSPS SAASAFLGNY PWYHQTSGSA SHLQATAPLL
HPTQTPQPHH HHHHHGGGGA PVSAGTIF
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , білків розвитку , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші