FOXC2

FOXC2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1D5V
Ідентифікатори
Символи	FOXC2, FKHL14, LD, MFH-1, MFH1, forkhead box C2
Зовнішні ІД	OMIM: 602402 MGI: 1347481 HomoloGene: 21091 GeneCards: FOXC2
Пов'язані генетичні захворювання
Lymphedema–distichiasis syndrome
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • chromatin DNA binding • promoter-specific chromatin binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця Біологічний процес • Сигнальний шлях Notch • somitogenesis • embryonic skeletal system morphogenesis • skeletal system development • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway • ureteric bud development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • neural crest cell development • paraxial mesoderm formation • paraxial mesodermal cell fate commitment • осифікація • lymphangiogenesis • collagen fibril organization • розвиток нирки • glomerular mesangial cell development • heart morphogenesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • cardiac muscle cell proliferation • lymph vessel development • transcription, DNA-templated • embryonic heart tube development • positive regulation of endothelial cell migration • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • ventricular cardiac muscle tissue morphogenesis • heart development • blood vessel remodeling • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway • blood vessel development • positive regulation of vascular wound healing • artery morphogenesis • branching involved in blood vessel morphogenesis • glomerular visceral epithelial cell differentiation • response to hormone • embryonic viscerocranium morphogenesis • embryonic cranial skeleton morphogenesis • camera-type eye development • glomerular endothelium development • positive regulation of cell adhesion mediated by integrin • mesoderm development • regulation of organ growth • metanephros development • проліферація • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of apoptotic process involved in outflow tract morphogenesis • transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • negative regulation of cold-induced thermogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2303	14234
Ensembl	ENSG00000176692	ENSMUSG00000046714
UniProt	Q99958	Q61850
RefSeq (мРНК)	NM_005251	NM_013519
RefSeq (білок)	NP_005242	NP_038547
Локус (UCSC)	Хр. 16: 86.57 – 86.57 Mb	Хр. 8: 121.84 – 121.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FOXC2 (англ. Forkhead box C2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 501 амінокислот, а молекулярна маса — 53 719.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQARYSVSDP		NALGVVPYLS		EQNYYRAAGS		YGGMASPMGV		YSGHPEQYSA
GMGRSYAPYH		HHQPAAPKDL		VKPPYSYIAL		ITMAIQNAPE		KKITLNGIYQ
FIMDRFPFYR		ENKQGWQNSI		RHNLSLNECF		VKVPRDDKKP		GKGSYWTLDP
DSYNMFENGS		FLRRRRRFKK		KDVSKEKEER		AHLKEPPPAA		SKGAPATPHL
ADAPKEAEKK		VVIKSEAASP		ALPVITKVET		LSPESALQGS		PRSAASTPAG
SPDGSLPEHH		AAAPNGLPGF		SVENIMTLRT		SPPGGELSPG		AGRAGLVVPP
LALPYAAAPP		AAYGQPCAQG		LEAGAAGGYQ		CSMRAMSLYT		GAERPAHMCV
PPALDEALSD		HPSGPTSPLS		ALNLAAGQEG		ALAATGHHHQ		HHGHHHPQAP
PPPPAPQPQP		TPQPGAAAAQ		AASWYLNHSG		DLNHLPGHTF		AAQQQTFPNV
REMFNSHRLG		IENSTLGESQ		VSGNASCQLP		YRSTPPLYRH		AAPYSYDCTK
Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Miura N., Iida K., Kakinuma H., Yang X.-L., Sugiyama T. (1997). Isolation of the mouse (MFH-1) and human (FKHL 14) mesenchyme fork head-1 genes reveals conservation of their gene and protein structures. Genomics. 41: 489—492. PMID 9169153 DOI:10.1006/geno.1997.4695
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• van Dongen M.J., Cederberg A., Carlsson P., Enerback S., Wikstrom M. (2000). Solution structure and dynamics of the DNA-binding domain of the adipocyte-transcription factor FREAC-11. J. Mol. Biol. 296: 351—359. PMID 10669593 DOI:10.1006/jmbi.1999.3476

Див. також

• Хромосома 16