Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
POU3F2
Ідентифікатори
Символи
POU3F2 , BRN2, N-Oct3, OCT7, OTF-7, OTF7, POUF3, brn-2, oct-7, POU class 3 homeobox 2
Зовнішні ІД
OMIM : 600494 MGI: 101895 HomoloGene: 4095 GeneCards: POU3F2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• transcription regulator complex • клітинне ядро
Біологічний процес
• cellular response to organic substance • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • astrocyte development • hypothalamus cell differentiation • Schwann cell development • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of gene expression • myelination in peripheral nervous system • transcription, DNA-templated • regulation of axonogenesis • forebrain ventricular zone progenitor cell division • neurohypophysis development • brain development • positive regulation of cell population proliferation • epidermis development • positive regulation of multicellular organism growth • регуляція диференціювання клітин • cerebral cortex radially oriented cell migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • нейробіологія розвитку • neuron differentiation • neuron fate commitment • neuron fate specification • neuron development • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 6: 98.83 – 98.84 Mb
н/д
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
POU3F2 (англ. POU class 3 homeobox 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 443 амінокислот , а молекулярна маса — 46 893[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MATAASNHYS LLTSSASIVH AEPPGGMQQG AGGYREAQSL VQGDYGALQS
NGHPLSHAHQ WITALSHGGG GGGGGGGGGG GGGGGGGGDG SPWSTSPLGQ
PDIKPSVVVQ QGGRGDELHG PGALQQQHQQ QQQQQQQQQQ QQQQQQQQQR
PPHLVHHAAN HHPGPGAWRS AAAAAHLPPS MGASNGGLLY SQPSFTVNGM
LGAGGQPAGL HHHGLRDAHD EPHHADHHPH PHSHPHQQPP PPPPPQGPPG
HPGAHHDPHS DEDTPTSDDL EQFAKQFKQR RIKLGFTQAD VGLALGTLYG
NVFSQTTICR FEALQLSFKN MCKLKPLLNK WLEEADSSSG SPTSIDKIAA
QGRKRKKRTS IEVSVKGALE SHFLKCPKPS AQEITSLADS LQLEKEVVRV
WFCNRRQKEK RMTPPGGTLP GAEDVYGGSR DTPPHHGVQT PVQ
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація клітин , нейрогенез .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Schreiber E., Tobler A., Malipiero U., Schaffner W., Fontana A. (1993). cDNA cloning of human N-Oct3, a nervous-system specific POU domain transcription factor binding to the octamer DNA motif. Nucleic Acids Res . 21 : 253—258. PMID 8441633 DOI :10.1093/nar/21.2.253
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші