Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NEUROD2
Ідентифікатори
Символи
NEUROD2 , NDRF, bHLHa1, neuronal differentiation 2, EIEE72, DEE72
Зовнішні ІД
OMIM : 601725 MGI: 107755 HomoloGene: 4489 GeneCards: NEUROD2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • protein dimerization activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • E-box binding • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• cellular response to calcium ion • regulation of neuron differentiation • диференціація клітин • negative regulation of nucleic acid-templated transcription • positive regulation of calcium-mediated signaling • associative learning • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • neuron development • transcription by RNA polymerase II • behavioral fear response • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • positive regulation of synaptic plasticity • negative regulation of synapse maturation • multicellular organism development • positive regulation of synapse maturation • Убіквітин-залежний протеоліз • positive regulation of neuron differentiation • cerebellar cortex development • regulation of synapse maturation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to electrical stimulus
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 39.6 – 39.61 Mb
Хр. 11: 98.22 – 98.22 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NEUROD2 (англ. Neuronal differentiation 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 382 амінокислот , а молекулярна маса — 41 361[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLTRLFSEPG LLSDVPKFAS WGDGEDDEPR SDKGDAPPPP PPAPGPGAPG
PARAAKPVPL RGEEGTEATL AEVKEEGELG GEEEEEEEEE EGLDEAEGER
PKKRGPKKRK MTKARLERSK LRRQKANARE RNRMHDLNAA LDNLRKVVPC
YSKTQKLSKI ETLRLAKNYI WALSEILRSG KRPDLVSYVQ TLCKGLSQPT
TNLVAGCLQL NSRNFLTEQG ADGAGRFHGS GGPFAMHPYP YPCSRLAGAQ
CQAAGGLGGG AAHALRTHGY CAAYETLYAA AGGGGASPDY NSSEYEGPLS
PPLCLNGNFS LKQDSSPDHE KSYHYSMHYS ALPGSRPTGH GLVFGSSAVR
GGVHSENLLS YDMHLHHDRG PMYEELNAFF HN
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація клітин , нейрогенез .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші