Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
FOXJ1
Ідентифікатори
Символи
FOXJ1 , FKHL13, HFH-4, HFH4, forkhead box J1, CILD43
Зовнішні ІД
OMIM : 602291 MGI: 1347474 HomoloGene: 1117 GeneCards: FOXJ1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• determination of left/right symmetry • positive regulation of lung ciliated cell differentiation • cell projection organization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • metanephric part of ureteric bud development • pattern specification process • transcription, DNA-templated • glomerular parietal epithelial cell development • regulation of epithelial cell differentiation • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of T cell proliferation • left/right pattern formation • Сперматогенез • heart development • negative regulation of T cell differentiation in thymus • cilium assembly • establishment of apical/basal cell polarity • GO:0032861, GO:0032862, GO:0032856 activation of GTPase activity • negative regulation of B cell activation • positive regulation of central B cell tolerance induction • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • epithelium development • negative regulation of humoral immune response mediated by circulating immunoglobulin • brain development • humoral immune response • negative regulation of germinal center formation • central tolerance induction • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • lung epithelium development • actin cytoskeleton organization • leukocyte migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • motile cilium assembly • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 76.14 – 76.14 Mb
Хр. 11: 116.22 – 116.23 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
FOXJ1 (англ. Forkhead box J1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 421 амінокислот , а молекулярна маса — 45 247[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAESWLRLSG AGPAEEAGPE GGLEEPDALD DSLTSLQWLQ EFSILNAKAP
ALPPGGTDPH GYHQVPGSAA PGSPLAADPA CLGQPHTPGK PTSSCTSRSA
PPGLQAPPPD DVDYATNPHV KPPYSYATLI CMAMQASKAT KITLSAIYKW
ITDNFCYFRH ADPTWQNSIR HNLSLNKCFI KVPREKDEPG KGGFWRIDPQ
YAERLLSGAF KKRRLPPVHI HPAFARQAAQ EPSAVPRAGP LTVNTEAQQL
LREFEEATGE AGWGAGEGRL GHKRKQPLPK RVAKVPRPPS TLLPTPEEQG
ELEPLKGNFD WEAIFDAGTL GGELGALEAL ELSPPLSPAS HVDVDLTIHG
RHIDCPATWG PSVEQAADSL DFDETFLATS FLQHPWDESG SGCLPPEPLF
EAGDATLASD LQDWASVGAF L
Кодований геном білок за функцією належить до активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , біогенез та деградація війок.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Li C.-S., Chae S.-C., Lee J.-H., Zhang Q., Chung H.-T. (2006). Identification of single nucleotide polymorphisms in FOXJ1 and their association with allergic rhinitis. J. Hum. Genet . 51 : 292—297. PMID 16518568 DOI :10.1007/s10038-006-0359-8
Pelletier G.J., Brody S.L., Liapis H., White R.A., Hackett B.P. (1998). A human forkhead/winged-helix transcription factor expressed in developing pulmonary and renal epithelium. Am. J. Physiol . 274 : L351—L359. PMID 9530170
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші