Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
RELB
Наявні структури
PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
1ZK9 , 1ZKA , 2V2T , 3DO7 , 3JSS , 3JUZ , 3JV0 , 3JV4 , 3JV6 , 4JGM , 4JHB
Ідентифікатори
Символи
RELB , I-REL, IREL, REL-B, RELB proto-oncogene, NF-kB subunit, IMD53
Зовнішні ІД
OMIM : 604758 MGI: 103289 HomoloGene: 4747 GeneCards: RELB
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase binding • identical protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• I-kappaB/NF-kappaB complex • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • центросома • GO:0009327 protein-containing complex • transcription repressor complex
Біологічний процес
• response to cytokine • antigen processing and presentation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ритмічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • myeloid dendritic cell differentiation • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • T-helper 1 cell differentiation • negative regulation of interferon-beta production • circadian regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • cellular response to osmotic stress • GO:1901313 positive regulation of gene expression • NIK/NF-kappaB signaling • T-helper 1 type immune response • inflammatory response • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • вроджений імунітет • lymphocyte differentiation
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 45 – 45.04 Mb
Хр. 7: 19.34 – 19.36 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
RELB (англ. RELB proto-oncogene, NF-kB subunit ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 579 амінокислот , а молекулярна маса — 62 134[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLRSGPASGP SVPTGRAMPS RRVARPPAAP ELGALGSPDL SSLSLAVSRS
TDELEIIDEY IKENGFGLDG GQPGPGEGLP RLVSRGAASL STVTLGPVAP
PATPPPWGCP LGRLVSPAPG PGPQPHLVIT EQPKQRGMRF RYECEGRSAG
SILGESSTEA SKTLPAIELR DCGGLREVEV TACLVWKDWP HRVHPHSLVG
KDCTDGICRV RLRPHVSPRH SFNNLGIQCV RKKEIEAAIE RKIQLGIDPY
NAGSLKNHQE VDMNVVRICF QASYRDQQGQ MRRMDPVLSE PVYDKKSTNT
SELRICRINK ESGPCTGGEE LYLLCDKVQK EDISVVFSRA SWEGRADFSQ
ADVHRQIAIV FKTPPYEDLE IVEPVTVNVF LQRLTDGVCS EPLPFTYLPR
DHDSYGVDKK RKRGMPDVLG ELNSSDPHGI ESKRRKKKPA ILDHFLPNHG
SGPFLPPSAL LPDPDFFSGT VSLPGLEPPG GPDLLDDGFA YDPTAPTLFT
MLDLLPPAPP HASAVVCSGG AGAVVGETPG PEPLTLDSYQ APGPGDGGTA
SLVGSNMFPN HYREAAFGGG LLSPGPEAT
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , біологічні ритми.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , цитоскелеті , ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші