Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
KLF17
Ідентифікатори
Символи
KLF17 , ZNF393, Zfp393, Kruppel-like factor 17, Kruppel like factor 17, ZLF393
Зовнішні ІД
OMIM : 609602 MGI: 2181068 HomoloGene: 12621 GeneCards: KLF17
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 44.12 – 44.14 Mb
Хр. 4: 117.62 – 117.62 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
KLF17 (англ. Kruppel like factor 17 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 389 амінокислот , а молекулярна маса — 42 577[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MYGRPQAEME QEAGELSRWQ AAHQAAQDNE NSAPILNMSS SSGSSGVHTS
WNQGLPSIQH FPHSAEMLGS PLVSVEAPGQ NVNEGGPQFS MPLPERGMSY
CPQATLTPSR MIYCQRMSPP QQEMTIFSGP QLMPVGEPNI PRVARPFGGN
LRMPPNGLPV SASTGIPIMS HTGNPPVPYP GLSTVPSDET LLGPTVPSTE
AQAVLPSMAQ MLPPQDAHDL GMPPAESQSL LVLGSQDSLV SQPDSQEGPF
LPEQPGPAPQ TVEKNSRPQE GTGRRGSSEA RPYCCNYENC GKAYTKRSHL
VSHQRKHTGE RPYSCNWESC SWSFFRSDEL RRHMRVHTRY RPYKCDQCSR
EFMRSDHLKQ HQKTHRPGPS DPQANNNNGE QDSPPAAGP
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші