Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
RFX3
Ідентифікатори
Символи
RFX3 , regulatory factor X3
Зовнішні ІД
OMIM : 601337 MGI: 106582 HomoloGene: 7917 GeneCards: RFX3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• transcription regulator complex • клітинне ядро • extracellular region
Біологічний процес
• диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of type B pancreatic cell development • regulation of insulin secretion • epithelial cilium movement involved in determination of left/right asymmetry • cell maturation • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • type B pancreatic cell maturation • determination of left/right symmetry • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • cilium-dependent cell motility • endocrine pancreas development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • type B pancreatic cell differentiation • cilium assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 9: 3.22 – 3.53 Mb
Хр. 19: 27.74 – 27.99 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
RFX3 (англ. Regulatory factor X3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 749 амінокислот , а молекулярна маса — 83 530[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MQTSETGSDT GSTVTLQTSV ASQAAVPTQV VQQVPVQQQV QQVQTVQQVQ
HVYPAQVQYV EGSDTVYTNG AIRTTTYPYT ETQMYSQNTG GNYFDTQGSS
AQVTTVVSSH SMVGTGGIQM GVTGGQLISS SGGTYLIGNS MENSGHSVTH
TTRASPATIE MAIETLQKSD GLSTHRSSLL NSHLQWLLDN YETAEGVSLP
RSTLYNHYLR HCQEHKLDPV NAASFGKLIR SIFMGLRTRR LGTRGNSKYH
YYGIRVKPDS PLNRLQEDMQ YMAMRQQPMQ QKQRYKPMQK VDGVADGFTG
SGQQTGTSVE QTVIAQSQHH QQFLDASRAL PEFGEVEISS LPDGTTFEDI
KSLQSLYREH CEAILDVVVN LQFSLIEKLW QTFWRYSPST PTDGTTITES
SNLSEIESRL PKAKLITLCK HESILKWMCN CDHGMYQALV EILIPDVLRP
IPSALTQAIR NFAKSLEGWL SNAMNNIPQR MIQTKVAAVS AFAQTLRRYT
SLNHLAQAAR AVLQNTSQIN QMLSDLNRVD FANVQEQASW VCQCDDNMVQ
RLETDFKMTL QQQSTLEQWA AWLDNVMMQA LKPYEGRPSF PKAARQFLLK
WSFYSSMVIR DLTLRSAASF GSFHLIRLLY DEYMFYLVEH RVAQATGETP
IAVMGEFGDL NAVSPGNLDK DEGSEVESEM DEELDDSSEP QAKREKTELS
QAFPVGCMQP VLETGVQPSL LNPIHSEHIV TSTQTIRQCS ATGNTYTAV
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , диференціація клітин , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші