GATA1

GATA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1GNF, 1Y0J, 2L5E, 2L6Y, 2L6Z, 3VD6, 3VEK
Ідентифікатори
Символи	GATA1, ERYF1, GATA-1, GF-1, GF1, NF-E1, NFE1, XLANP, XLTDA, XLTT, GATA binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 305371 MGI: 95661 HomoloGene: 1549 GeneCards: GATA1
Пов'язані генетичні захворювання
X-linked dyserythropoetic anemia with abnormal platelets and neutropenia, Diamond-Blackfan anemia
Онтологія гена Молекулярна функція • C2H2 zinc finger domain binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • DNA binding • p53 binding • DNA binding, bending • chromatin DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • transcription repressor complex • transcription regulator complex • protein-DNA complex Біологічний процес • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of transcription regulatory region DNA binding • eosinophil fate commitment • in utero embryonic development • regulation of glycoprotein biosynthetic process • cellular response to thyroid hormone stimulus • зсідання крові • erythrocyte differentiation • Тромбоцитопоез • positive regulation of osteoblast proliferation • transcription by RNA polymerase II • platelet aggregation • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of primitive erythrocyte differentiation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • regulation of definitive erythrocyte differentiation • cell-cell signaling • embryonic hemopoiesis • розвиток клітин • positive regulation of erythrocyte differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • megakaryocyte differentiation • dendritic cell differentiation • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • negative regulation of bone mineralization • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • male gonad development • myeloid cell differentiation • negative regulation of apoptotic process • homeostasis of number of cells within a tissue • transcription, DNA-templated • basophil differentiation • eosinophil differentiation • erythrocyte development • regulation of megakaryocyte differentiation • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • heart development • animal organ morphogenesis • гістогенез • anatomical structure formation involved in morphogenesis • digestive tract development Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2623	14460
Ensembl	ENSG00000102145	ENSMUSG00000031162
UniProt	P15976	P17679
RefSeq (мРНК)	NM_002049	NM_008089
RefSeq (білок)	NP_002040	NP_032115
Локус (UCSC)	Хр. X: 48.79 – 48.79 Mb	Хр. X: 7.83 – 7.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GATA1 (англ. GATA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 413 амінокислот, а молекулярна маса — 42 751.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEFPGLGSLG		TSEPLPQFVD		PALVSSTPES		GVFFPSGPEG		LDAAASSTAP
STATAAAAAL		AYYRDAEAYR		HSPVFQVYPL		LNCMEGIPGG		SPYAGWAYGK
TGLYPASTVC		PTREDSPPQA		VEDLDGKGST		SFLETLKTER		LSPDLLTLGP
ALPSSLPVPN		SAYGGPDFSS		TFFSPTGSPL		NSAAYSSPKL		RGTLPLPPCE
ARECVNCGAT		ATPLWRRDRT		GHYLCNACGL		YHKMNGQNRP		LIRPKKRLIV
SKRAGTQCTN		CQTTTTTLWR		RNASGDPVCN		ACGLYYKLHQ		VNRPLTMRKD
GIQTRNRKAS		GKGKKKRGSS		LGGTGAAEGP		AGGFMVVAGG		SGSGNCGEVA
SGLTLGPPGT		AHLYQGLGPV		VLSGPVSHLM		PFPGPLLGSP		TGSFPTGPMP
PTTSTTVVAP		LSS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Trainor C.D., Evans T., Felsenfeld G., Boguski M.S. (1990). Structure and evolution of a human erythroid transcription factor. Nature. 343: 92—96. PMID 2104960 DOI:10.1038/343092a0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Calligaris R., Bottardi S., Cogoi S., Apezteguia I., Santoro C. (1995). Alternative translation initiation site usage results in two functionally distinct forms of the GATA-1 transcription factor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 11598—11602. PMID 8524811 DOI:10.1073/pnas.92.25.11598
• Boyes J., Byfield P., Nakatani Y., Ogryzko V. (1998). Regulation of activity of the transcription factor GATA-1 by acetylation. Nature. 396: 594—598. PMID 9859997 DOI:10.1038/25166
• Kuo Y.-Y., Chang Z.-F. (2007). GATA-1 and Gfi-1B interplay to regulate Bcl-xL transcription. Mol. Cell. Biol. 27: 4261—4272. PMID 17420275 DOI:10.1128/MCB.02212-06
• Mehaffey M.G., Newton A.L., Gandhi M.J., Crossley M., Drachman J.G. (2001). X-linked thrombocytopenia caused by a novel mutation of GATA-1. Blood. 98: 2681—2688. PMID 11675338 DOI:10.1182/blood.V98.9.2681

Див. також

• Хромосома X