Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
TFAP2D
Ідентифікатори
Символи
TFAP2D , TFAP2BL1, transcription factor AP-2 delta, AP-2delta
Зовнішні ІД
OMIM : 610161 MGI: 2153466 HomoloGene: 17700 GeneCards: TFAP2D
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • transcription regulator complex
Біологічний процес
• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cell population proliferation • inferior colliculus development • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:1903374 anatomical structure development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 6: 50.71 – 50.77 Mb
Хр. 1: 19.17 – 19.24 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
TFAP2D (англ. Transcription factor AP-2 delta ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 452 амінокислот , а молекулярна маса — 49 578[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSTTFPGLVH DAEIRHDGSN SYRLMQLGCL ESVANSTVAY SSSSPLTYST
TGTEFASPYF STNHQYTPLH HQSFHYEFQH SHPAVTPDAY SLNSLHHSQQ
YYQQIHHGEP TDFINLHNAR ALKSSCLDEQ RRELGCLDAY RRHDLSLMSH
GSQYGMHPDQ RLLPGPSLGL AAAGADDLQG SVEAQCGLVL NGQGGVIRRG
GTCVVNPTDL FCSVPGRLSL LSSTSKYKVT IAEVKRRLSP PECLNASLLG
GILRRAKSKN GGRCLREKLD RLGLNLPAGR RKAANVTLLT SLVEGEALHL
ARDFGYTCET EFPAKAVGEH LARQHMEQKE QTARKKMILA TKQICKEFQD
LLSQDRSPLG SSRPTPILDL DIQRHLTHFS LITHGFGTPA ICAALSTFQT
VLSEMLNYLE KHTTHKNGGA ADSGQGHANS EKAPLRKTSE AAVKEGKTEK
TD
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші