Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXD11
Ідентифікатори
Символи
HOXD11 , HOX4, HOX4F, homeobox D11
Зовнішні ІД
OMIM : 142986 MGI: 96203 HomoloGene: 7368 GeneCards: HOXD11
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро • нуклеоплазма
Біологічний процес
• multicellular organism development • branching involved in ureteric bud morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • dorsal/ventral pattern formation • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 176.1 – 176.11 Mb
Хр. 2: 74.51 – 74.52 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HOXD11 (англ. Homeobox D11 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот , а молекулярна маса — 35 197[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MNDFDECGQS AASMYLPGCA YYVAPSDFAS KPSFLSQPSS CQMTFPYSSN
LAPHVQPVRE VAFRDYGLER AKWPYRGGGG GGSAGGGSSG GGPGGGGGGA
GGYAPYYAAA AAAAAAAAAA EEAAMQRELL PPAGRRPDVL FKAPEPVCAA
PGPPHGPAGA ASNFYSAVGR NGILPQGFDQ FYEAAPGPPF AGPQPPPPPA
PPQPEGAADK GDPRTGAGGG GGSPCTKATP GSEPKGAAEG SGGDGEGPPG
EAGAEKSSSA VAPQRSRKKR CPYTKYQIRE LEREFFFNVY INKEKRLQLS
RMLNLTDRQV KIWFQNRRMK EKKLNRDRLQ YFTGNPLF
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція , регуляція транскрипції , поліморфізм.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші