IRX6

IRX6
Ідентифікатори
Символи	IRX6, IRX-3, IRX7, IRXB3, iroquois homeobox 6
Зовнішні ІД	OMIM: 606196 MGI: 1927642 HomoloGene: 41481 GeneCards: IRX6
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79190	64379
Ensembl	ENSG00000159387	ENSMUSG00000031738
UniProt	P78412	Q9ER75
RefSeq (мРНК)	NM_024335	NM_001301137 NM_022428
RefSeq (білок)	NP_077311	NP_001288066 NP_071873
Локус (UCSC)	Хр. 16: 55.32 – 55.33 Mb	Хр. 8: 93.4 – 93.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IRX6 (англ. Iroquois homeobox 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 446 амінокислот, а молекулярна маса — 48 240.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSFPHFGHPY		RGASQFLASA		SSSTTCCEST		QRSVSDVASG		STPAPALCCA
PYDSRLLGSA		RPELGAALGI		YGAPYAAAAA		AQSYPGYLPY		SPEPPSLYGA
LNPQYEFKEA		AGSFTSSLAQ		PGAYYPYERT		LGQYQYERYG		AVELSGAGRR
KNATRETTST		LKAWLNEHRK		NPYPTKGEKI		MLAIITKMTL		TQVSTWFANA
RRRLKKENKM		TWAPKNKGGE		ERKAEGGEED		SLGCLTADTK		EVTASQEARG
LRLSDLEDLE		EEEEEEEEAE		DEEVVATAGD		RLTEFRKGAQ		SLPGPCAAAR
EGRLERRECG		LAAPRFSFND		PSGSEEADFL		SAETGSPRLT		MHYPCLEKPR
IWSLAHTATA		SAVEGAPPAR		PRPRSPECRM		IPGQPPASAR		RLSVPRDSAC
DESSCIPKAF		GNPKFALQGL		PLNCAPCPRR		SEPVVQCQYP		SGAEAG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16