Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
KLF9
Ідентифікатори
Символи
KLF9 , BTEB, BTEB1, Kruppel-like factor 9, Kruppel like factor 9
Зовнішні ІД
OMIM : 602902 MGI: 1333856 HomoloGene: 931 GeneCards: KLF9
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинна мембрана • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма
Біологічний процес
• GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to cortisol stimulus • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • циркадний ритм • negative regulation of keratinocyte proliferation • transcription, DNA-templated • cellular response to thyroid hormone stimulus • ритмічний процес
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 9: 70.38 – 70.41 Mb
Хр. 19: 23.12 – 23.15 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
KLF9 (англ. Kruppel like factor 9 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 244 амінокислот , а молекулярна маса — 27 235[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSAAAYMDFV AAQCLVSISN RAAVPEHGVA PDAERLRLPE REVTKEHGDP
GDTWKDYCTL VTIAKSLLDL NKYRPIQTPS VCSDSLESPD EDMGSDSDVT
TESGSSPSHS PEERQDPGSA PSPLSLLHPG VAAKGKHASE KRHKCPYSGC
GKVYGKSSHL KAHYRVHTGE RPFPCTWPDC LKKFSRSDEL TRHYRTHTGE
KQFRCPLCEK RFMRSDHLTK HARRHTEFHP SMIKRSKKAL ANAL
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , біологічні ритми.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку , ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші