NR2C1

NR2C1
Ідентифікатори
Символи	NR2C1, TR2, Testicular receptor 2, nuclear receptor subfamily 2 group C member 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601529 MGI: 1352465 HomoloGene: 55731 GeneCards: NR2C1
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • histone deacetylase binding • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • steroid hormone receptor activity • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • signaling receptor activity Клітинна компонента • PML body • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of retinoic acid receptor signaling pathway • transcription initiation from RNA polymerase II promoter • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • steroid hormone mediated signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7181	22025
Ensembl	ENSG00000120798	ENSMUSG00000005897
UniProt	P13056	Q505F1
RefSeq (мРНК)	NM_001032287 NM_001127362 NM_003297	NM_011629
RefSeq (білок)	NP_001027458 NP_001120834 NP_003288 NP_003288.2	NP_035759
Локус (UCSC)	Хр. 12: 95.02 – 95.07 Mb	Хр. 10: 93.98 – 94.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NR2C1 (англ. Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 603 амінокислот, а молекулярна маса — 67 315.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATIEEIAHQ		IIEQQMGEIV		TEQQTGQKIQ		IVTALDHNTQ		GKQFILTNHD
GSTPSKVILA		RQDSTPGKVF		LTTPDAAGVN		QLFFTTPDLS		AQHLQLLTDN
SPDQGPNKVF		DLCVVCGDKA		SGRHYGAVTC		EGCKGFFKRS		IRKNLVYSCR
GSKDCIINKH		HRNRCQYCRL		QRCIAFGMKQ		DSVQCERKPI		EVSREKSSNC
AASTEKIYIR		KDLRSPLTAT		PTFVTDSEST		RSTGLLDSGM		FMNIHPSGVK
TESAVLMTSD		KAESCQGDLS		TLANVVTSLA		NLGKTKDLSQ		NSNEMSMIES
LSNDDTSLCE		FQEMQTNGDV		SRAFDTLAKA		LNPGESTACQ		SSVAGMEGSV
HLITGDSSIN		YTEKEGPLLS		DSHVAFRLTM		PSPMPEYLNV		HYIGESASRL
LFLSMHWALS		IPSFQALGQE		NSISLVKAYW		NELFTLGLAQ		CWQVMNVATI
LATFVNCLHN		SLQQDKMSTE		RRKLLMEHIF		KLQEFCNSMV		KLCIDGYEYA
YLKAIVLFSP		DHPSLENMEQ		IEKFQEKAYV		EFQDYITKTY		PDDTYRLSRL
LLRLPALRLM		NATITEELFF		KGLIGNIRID		SVIPHILKME		PADYNSQIIG
HSI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, рецепторів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Chang C., Kokontis J. (1988). Identification of a new member of the steroid receptor super-family by cloning and sequence analysis. Biochem. Biophys. Res. Commun. 155: 971—977. PMID 3421977 DOI:10.1016/S0006-291X(88)80591-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lin Y.L., Wang Y.H., Lee H.J. (2006). Transcriptional regulation of the human TR2 orphan receptor gene by nuclear factor 1-A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 350: 430—436. PMID 17010934 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.09.061

Див. також

• Хромосома 12